Digital Organism Simulation Environment (DOSE): A Library for Ecologically-Based In Silico Experimental Evolution

  • سال انتشار: 1392
  • محل انتشار: مجله بین المللی پیشرفت در علوم کامپیوتر، دوره: 3، شماره: 1
  • کد COI اختصاصی: JR_ACSIJ-3-1_007
  • زبان مقاله: انگلیسی
  • تعداد مشاهده: 739
دانلود فایل این مقاله

نویسندگان

Clarence FG Castillo

School of Information Technology, Republic Polytechnic Singapore, Republic of Singapore

Maurice HT Ling

School of Chemical and Biomedical Engineering, Nanyang Technological University Singapore, Republic of Singapore Department of Zoology, The University of Melbourne Parkville, Victoria ۳۰۱۰, Australia

چکیده

Testing evolutionary hypothesis in biological setting is expensive and time consuming. Computer simulations of organisms (digital organisms) are commonly used proxies tostudy evolutionary processes. A number of digital organism simulators have been developed but are deficient in biologicaland ecological parallels. In this study, we present DOSE (Digital Organism Simulation Environment), a digital organism simulator with biological and ecological parallels. DOSEconsists of a biological hierarchy of genetic sequences, organism, population, and ecosystem. A 3-character instruction set thatdoes not take any operand is used as genetic code for digital organism, which the 3-nucleotide codon structure in naturallyoccurring DNA. The evolutionary driver is simulated by a genetic algorithm. We demonstrate the utility in examining the effects of migration on heterozygosity, also known as local genetic distance

کلیدواژه ها

Digital Organisms, Simulation Environment,Ecology Simulation, Migration, Genetic Distance

مقالات مرتبط جدید

اطلاعات بیشتر در مورد COI

COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.

کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.