تجزیه و تحلیل تفاوت تک نوکلئتیدی ((SNP) در ژن و پروتئین های درگیر در شکل دانه برنج
- سال انتشار: 1391
- محل انتشار: دوازدهمین کنگره ژنتیک ایران
- کد COI اختصاصی: CIGS12_0848
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 948
نویسندگان
گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشگاه علوم کشارزی و منابع طبیعی ساری
پژوهشکده ژنتیک و زیست فناوری کشاورزی طبرستان، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری
بخش زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید باهنر کرمان
پژوهشکده ژنتیک و زیست فناوری کشاورزی طبرستان، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری
چکیده
طول و شکل دانه برنج بدلیل تعیین شکل ظاهری و تأثیر آن بر پخت همواره مورد توجه مصرف کنندگان بوده است. ازاینرو آگاهی از رفتار ژنتیکی این صفات در اصلاح واریته ها ضروری بنظر می رسد. در دهه گذشته تعداد زیادی QTL همبسته به صفت اندازه دانه شناسایی شده که در این میان QTL بزرگ اثر موجود در ناحیه سانترومری کروموزوم شماره 3 بسیار مورد توجه قرار گرفته است. تحقیقات اخیر نشان می دهد ژن gs3 به عنوان یک QTL بزرگ اثر درصد بالایی از تغییرات طول دانه (بیش از 80 درصد) و به عنوان یک QTL کوچک اثر تغییرات عرض و نسبت طول به عرض دانه را کنترل می نماید. دراین تحقیق اثر تغییرات تکنوکلئوتیدی (SNP) در اگزون شماره دو با استفاده از نرم افزارهای بیوانفورماتیکی مورد بررسی قرار گرفت. پروتئینهای حاصل از نواحی کد کننده طبیعی و دارای جهش این ژن از طریق تغییر در تک نوکلئوتید توالی بازیابی شده، ایجاد و مورد بررسی قرار گرفت. تجزیه و تحلیل پروتئین حاصل از GS3 نشان داد که این تفاوت تک نوکلئوتیدی باعث تبدیل یک کدون سیستئین (TGC) به یک کدون پایان (TGA) در سطح پروتئینی می شود. پروتئین کد شده توسط آلل غالب C منجر به تولید دانه های با طول کوتاه می شود، در حالیکه آلل دیگر، یک آلل مغلوب است ه پروتئینی ناقص را به وجود می آورد. جهش C به A در اگزون دوم GS3 به شدت با صفت طول دانه در برنج در ارتباط بوده بطوریکه بعنوان یک تنظیم کننده منفی اندازه دانه عمل می نماید.کلیدواژه ها
برنج، طول دانه، شکل دانه، GS3اطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.