کلونینگ و بیان دومین III پروتئین E ویروس تب دانگ در میزبان باکتریایی
- سال انتشار: 1391
- محل انتشار: دوازدهمین کنگره ژنتیک ایران
- کد COI اختصاصی: CIGS12_0429
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 769
نویسندگان
دانشجوی دکترای ژنتیک مولکولی، گروه ژنتیک دانشکده علوم زیستی، دانشگاه تربیت مدرس
دانشجوی دکترای ژنتیک مولکولی، گروه ژنتیک دانشکده علوم زیستی، دانشگاه تربیت مدرس
استاد گروه ژنتیک مولکولی، دانشکده علوم زیستی، دانشگاه تربیت مدرس
چکیده
مقدمه: ویروس دانگ باعث بروز تب حاد، تب خونریزی دهنده، سندرم شوک دانگ و حتی مرگ در انسان می وشد. هنوز دارو یا واکسن تأئید شده ای علیه این بیماری ایجاد نشده است. پروتئین پوششی E ویروس بعنان کاندید واکسن مورد توجه است. این پروتئین در ویژگیهای حیاتی ویروس مانند شناسایی گیرنده، الحاق غشایی، القای آنتی بادی های خنثی کننده و ایمنی محافظتی، ن قش اصلی را ایفا می کند. پروتئین E حاوی سه دومین II, I و III می باشد که دومین III نقش اساسی در ویژگیهای فوق دارد. هدف: هدف این مطالعه ایجاد آنتی زن نوترکیبی از پروتئین E سروتیپ 1 ویروس، به منظور دستیابی به کاندید واکسن دانگ است. بنابراین، قابلیت تولید دومین III این پروتئین در باکتری مودر بررسی قرار گرفت. روشها: همردیفی توالیهای مربوط به دومین III با نرم افزار Megalign،پیشینی ساختارهای سه گانه پروتئین با نرم افزارهای PSIpred, EditSeq و Modeller. پیش بینی اپیتوپها با نرم افزارهای Bcepred و discotop بهینه سازی توالی ژن برای بیان در E.coli با نرم افزار Optimizer. سنتز و کلونینگ ژن در وکتور بیانی pET21. انتقال وکتور به میزبان بیانی و بهینه سازی بیان پروتئین. نتایج: توالی آمینواسیدی حاصل (بنام EDIII1) با روشهای ایمونوانفورماتیک بررسی شد. سپس ساختار اول، دوم و سوم پروتئین پیش بینی شد. ا پیتوپهای خطی و فضایی مورد انتظار توسط روشهای معتبر تعیین شدند. به منظور بیان حداکثری پروتئین نوترکیب در باکتری، توالی ژن از لحاظ الگوی کدونی و درصد GC بهینه سازی شد. ژن هدف پس از سنتز، در وکتور بیانی pET21 در جایگاههای Ndel و Xhol کلون شد. به منظور ایجاد پیوند دیسولفیدی در ساختار پروتئین، بهینه سازی بیان EDIII1 در میزبان بیانی Origami انجام شد.کلیدواژه ها
ویروس دانگ، پروتئین EDIII1, Eمقالات مرتبط جدید
اطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.