انگشت نگاری بخشی از ژرمپلاسم برنج با استفاده از نشانگر مولکولی AFLP

  • سال انتشار: 1391
  • محل انتشار: دوازدهمین کنگره ژنتیک ایران
  • کد COI اختصاصی: CIGS12_0426
  • زبان مقاله: فارسی
  • تعداد مشاهده: 923
دانلود فایل این مقاله

نویسندگان

میثم علیزاده

گروه بیوتکنولوژی کشاورزی دانشگاه پیام نور تهران

قربانعلی نعمت زاده

پژوهشکده ژنتیک و زیست فناوری طبرستان، دانشگاه کشاورزی و منابع طبیعی ساری

محمدعلی ابراهیمی

گروه بیوتکنولوژی کشاورزی دانشگاه پیام نور تهران

سیدحمیدرضا هاشمی

پژوهشکده ژنتیک و زیست فناوری طبرستان، دانشگاه کشاورزی و منابع طبیعی ساری

چکیده

برنج بعد از گندم از مهمترین غلات به شمار می آید و غذای بیش از نیمی از مردم جهان را تشکیل می دهد. این گیاه همچنین جزء غذاهای اصلی مردم ایران محسوب می شود. در این پژوهش به منظور ارزیابی و انگشت نگاری بخشی از ژرمپلاسم برنج کشور که شامل 28 رقم محلی و 19 رقم خارجی می باشد، از نشانگر AFLP استفاده گردید. با استفاده از 10 ترکیب آغازگری تعداد 675 نوار (باند) بدست آمد که تعداد 429 نوار (63.5%) چندشلی نشان دادند. از بین آغازگرهای مورد استفاده، ترکیب آغازگری E-TTG, M-CAT با 107 نوار بیشترین تعداد نوار و ترکیب آغاز گری E-AGG, M-CTG با 34 نوار کمترین تعداد نوار را تلدی نمود. مقدار متوسط محتوای اطلاعات چندشکلی در این تحقیق (PIC) 0.65 برآورد گردید. بهترین ترکیب آغازگری برای تفکیک بهتر نمونه های برنج E-GTG, M-CCT با شاخص نشانگر 49 تشخیص داده شد. میانگین شباهت ژنتیکی بر پایه ضریب Nei، 0.67 تخمین زده شد (0.97- 0.40). دندروگرام بدست آمده با استفاده از روش UPGMA، چهار گروه اصلی را بین ارقام مورد بررسی مشخص نمود که با نتایج حاصل از تجزیه و تحلیل PCA نیز همخوانی داشت. در این تحقیق نشانگر AFLP توانست اثر ا نگشت منحصر به فردی را برای تمامی ارقام ایجاد کند. با توجه به شناسایی گروه های هتروتیک، از نتایج حاصل از این تحقیق می توان در برنامه ه ای اصلاحی جهت تولید ارقام هیبرید و امید بخش استفاده نمود.

کلیدواژه ها

انگشت نگاری، برنج، نشانگر مولکولی، AFLP

اطلاعات بیشتر در مورد COI

COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.

کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.