تعیین پروتئین های واسط در شبکه تعامل پروتئین-پروتئین با در نظر گرفتن بیماری های شایع در پروتئین های مون لایت
- سال انتشار: 1401
- محل انتشار: فصلنامه زیست فناوری، دوره: 13، شماره: 2
- کد COI اختصاصی: JR_BIOT-13-2_007
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 88
نویسندگان
Laboratory of Bioinformatics and Drug Design, Institute of Biochemistry and Biophysics, University of Tehran, Tehran, Iran,
Laboratory of Bioinformatics and Drug Design, Institute of Biochemistry and Biophysics, University of Tehran, Tehran, Iran,
چکیده
پروتئین های مون لایت یک زیر کلاس از پروتئین های چند عملکردی می باشند که در آن ها بیش از یک عملکرد مستقل یا معمولا متمایز در یک زنجیره پلی پپتیدی منفرد رخ می دهد. با تحلیل شبکه های تعاملی پروتئین ها در سلول، می توان درک کرد که چگونه فرایندهای پیچیده باعث بیماری می شوند. به کمک زیست شناسی سیستم ها، می توان سیستم های بزرگ تر و پیچیده تر را مطالعه کرد و به اساس مولکولی چند بیماری توجه داشت. پروتئین های ارگانیسم انسان که مون لایت هستند بیشتر در بیماری های سرطان، کم خونی و بیماری مرتبط با سیستم عصبی درگیر هستند. در این کار با توجه به شبکه PPI انسانی، یک زیر شبکه ایجاد شد که در آن نودها، پروتئین های ایجاد کننده سه بیماری منتخب و یال ها، ارتباط این پروتئین ها با یکدیگر می باشند. قدرت اثرات غیرمستقیم واسط های غیر بیماری بین سه گروه از بیماری ها اندازه گیری شد و پروتئین های واسط کلیدی متصل کننده بیماری ها شناسایی شدند. نتایج کار نشان دهنده ارتباط بین نقش واسط و مرکزیت و همچنین بین نقش واسط و ویژگی های عملکردی این پروتئین ها می باشد. مشاهده شد که یک پروتئین که نقش واسط کلیدی غیرمستقیم بین دو بیماری را بازی می کند، لزوما در شبکه PPI، هاب نمی باشد. بنابراین همانطور که پروتئین های هاب مورد توجه قرار می گیرند، باید پروتئین های واسط مورد توجه قرار بگیرند. ما مشاهده کردیم که واسط های بین بیماری های کم خونی و اعصاب از نظر عملکردی اهمیت زیادی در سلول دارند. پروتئین های واسطه ای که در این جا پیشنهاد شده اند، باید به صورت تجربی به عنوان پروتئین های فرضی مرتبط با بیماری آزمایش شوندکلیدواژه ها
protein-protein interaction network, Moonlighting proteins, diseases, پروتئین های مون لایتاطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.