استفاده از نشانگر RAPD برای ارزیابی گوناگونی ژنتیکی برخی از گونه های آویشن

  • سال انتشار: 1391
  • محل انتشار: مجله علمی تحقیقات ژنتیک و اصلاح گیاهان مرتعی و جنگلی ایران، دوره: 20، شماره: 2
  • کد COI اختصاصی: JR_IJRFP-20-2_002
  • زبان مقاله: فارسی
  • تعداد مشاهده: 74
دانلود فایل این مقاله

نویسندگان

S.B.L. Alamdary

کارشناس ارشد، بیوتکنولوژی کشاورزی، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری

A. Safarnejad

دانشیار، مرکز تحقیقات کشاورزی و منابع طبیعی خراسان رضوی

G.A. Nematzadeh

استاد، اصلاح نباتات، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری

چکیده

سیزده نمونه از گیاه دارویی آویشن، شامل۱۰ نمونه از گونه بومی Thymus daenensis  و نمونه های دیگر مربوط به گونه های T. migricus, T. pubsence  و T. fedtschenkoi مورد ارزیابی ژنتیکی قرار گرفتند. به منظور ارزیابی تنوع مولکولی نمونه های آویشن، DNA ژنومی به صورت بالک با استفاده از روش CTAB با کمی تغییرات، استخراج گردید. برای انجام واکنش PCR از۲۰ آغازگر رپید استفاده گردید که تنها ۸ آغازگر باندهای واضح و تکرارپذیر را نشان دادند. از مجموع ۹۷ باند تولید شده ۶۱% باندها چند شکل بودند. بیشترین تعداد قطعه تکثیر شده (۱۶عدد) مربوط به آغازگرOPA۹ و کمترین تعداد (۸ عدد) مربوط به آغازگر OPP۳ بود. نمونه های شماره ۸ (daenensis subs daenensis T.) و ۱۰ ( T. daenensis subs daenensis) در کمترین فاصله ژنتیکی (شباهت ۹۲%)  نسبت به هم و نمونه های شماره ۲ ( T. migricus ) و ۱۱ (T. daenensis subs daenensis) در دورترین فاصله (شباهت ۷۵%) نسبت به هم قرار داشتند. میانگین تنوع ژنی نی برابر با ۲۰۸۷/۰ به دست آمد. دندروگرام ترسیم شده در فاصله ژنتیکی ۸۰% دو گروه اصلی را بین ۱۳ نمونه مشخص کرد. در یک گروه نمونه هایی از سه گونهT. migricus ،T. daenensis  و T. pubsence قرار گرفتند و در گروه دوم دو گونهT.daenensis subs daenensis   و T. fedtschenkoi قرار گرفتند. به طورکلی بررسی تنوع در ژنوتیپ های آویشن با استفاده از نشانگر رپید نشان داد که این نشانگر در شناسایی نواحی چند شکلی و تخمین فاصله ژنتیکی و مدیریت ژرم پلاسم می تواند مفید باشد

کلیدواژه ها

آویشن, تنوع ژنتیکی, RAPD

اطلاعات بیشتر در مورد COI

COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.

کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.