مطالعه تنوع فیلوژنتیکی ژن LR10 در گونه های مختلف گندم با استفاده از تکنیک Insilco AFLP Analysis

  • سال انتشار: 1391
  • محل انتشار: سومین همایش ملی بیوتکنولوژی کشاورزی ایران (گیاهی، دامی و صنعتی)
  • کد COI اختصاصی: AGRIBIOTECH03_046
  • زبان مقاله: فارسی
  • تعداد مشاهده: 751
دانلود فایل این مقاله

نویسندگان

حسن رسولی

عضو هیئت مدیره شرکت فنی مهندسی کشاورزی سبزآذین راگا-گروه پژوهشی بیوتک

نیما باغبانی

عضو باشگاه پژوهشگران جوان دانشگاه آزاد اسلامی واحد سنندج

مهران فلک ناز

کارشناس ارشد اصلاح نباتات دانشگاه ایلام

دانیال کهریزی

گروه پژوهشی بیوتکنولوژی مقاومت به خشکی دانشگاه رازی کرمانشاه

چکیده

در این بررسی از 6 توالی ژن LR10 در گونههای مختلف گندم که از پایگاه اطلاعات ژنتیکی NCBI استخراج شده بود، استفاده گردید. با استفاده از نرمافزار آنلاین webcuter آنزیمهای برشی که دارای بیشترین سایت برشی در گونههای مورد نظر بودند انتخاب شدند. این آنزیمها عبارتند از ،EcoRI ،HindIII BamHI در مرحله بعد نرمافزار CLC Workbench به توالیها اعمال شد، نتایج حاصل توسط این نرمافزار به صورت شبیه ساز بر روی ژل برده شد. در مرحله بعد با توجه به وجود یا عدم وجود باند به نمونهها اعداد 1 و 0 داده شد و در برنامه Excel ذخیره گردید. در ادامه با استفاده از Darwin ماتریسهای عدم تشابه براساس الگوریتمهای دایس و جاکارد بهدست آمد. با استفاده از نرم افزار Mega درخت فیلوژنتیکی ترسیم و تفسیر شد. نتایج بدست آمده از این بررسی نشان داد که گونه های مختلف گندم از لحاظ ژن LR10 در 3 دسته تقسیم بندی می شوند.

کلیدواژه ها

تنوع فیلوژنتیکی، ژن Insilco AFLP Analysis ، LR10

مقالات مرتبط جدید

اطلاعات بیشتر در مورد COI

COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.

کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.