بررسی بیوانفورماتیکی ژن های گره زا در باکتری های همزیست با لگوم
- سال انتشار: 1391
- محل انتشار: سومین همایش ملی بیوتکنولوژی کشاورزی ایران (گیاهی، دامی و صنعتی)
- کد COI اختصاصی: AGRIBIOTECH03_034
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 1804
نویسندگان
دانشجوی دکتری گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی دانشگاه بوعلی سینا هم
دانشیار گروه گیاهپزشکی دانشکده کشاورزی دانشگاه بوعلی سینا همدان
چکیده
رایزوبیا Rhizobia یا ریزوبیوم گروهی از باکتری های خاکزاد هستند که با ارتباط همزیستی با خانواده لگومینوزه باعث تثبیت نیتروژن می شوند ،تثبیت نیتروژن با ایجاد گره در ریشه لگوم ها توسط این باکتری ها صورت می گیرد که لازمه ایجاد گره وجود ژن های گره زا در باکتری می باشند از جمله nif که در تنظیم و تولید آنزیم های نیتروژناز نقش دارند و ژن های nod برای سنتز فاکتورهای گره زایی لازمند. در این تحقیق توالی ژن های nodc و nifH 50 جدایه رایزوبیا و غیر رایزوبیایی که قادر به ایجاد گره در لگوم ها هستند از بانک اطلاعات NCBI گرفته شد . همردیف سازی چندگانه multiple sequence alignment توالی های نوکلوتیدی بدست آمده با استفاده از نرم افزار Clustal W صورت گرفت. درخت فیلوژنتیکی جدایه ها با روش اتصال همسایه ای Neighbour‐joining و با استفاده از نرم افزار MEGA5 با bootstrap 1000 تکرار ترسیم گردید. نتایج نشان داد که این ژن ها در بین گونه های رایزوبیا همولوژی بالایی دارند لذا برای مطالعات تاکسونومیکی مفید نیستند ولی برای شناسایی باکتری های غیررایزوبیایی که قادر به ایجاد گره در لگوم ها هستند و همچنین در مطالعات جغرافیای زیستی جدایه های همزیست با لگوم ها ابزاری مفید و کارآمد می باشند.کلیدواژه ها
رایزوبیا، ژن های گره زا ، nodc. ، nifHمقالات مرتبط جدید
- بررسی تنوع زیستی گیاهان مرتعی ارتفاعات کبیرکوه در جنوب دره شهر (استان ایلام)
- عوامل موثر بر میزان پیچان رودخانه های خرم اباد
- ارزیابی کیفیت آب شرب گاوهای شیری در گاوداری های صنعتی حومه مشهد از نظر وجود فلزات سنگین، نیترات و سولفات
- بیو پلیمر پلی ساکاریدی برای مصارف دامپزشکی
- راهکارهای کارآمد کاهش انتشار گازهای گلخانه ای از طریق فناوری کشاورزی هوشمند
اطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.