شناسایی نواحی ژنومی تحت انتخاب مثبت برای سازگاری با ارتفاع بالا در گوسفندان ایرانی
- سال انتشار: 1403
- محل انتشار: فصلنامه علوم دامی ایران، دوره: 55، شماره: 1
- کد COI اختصاصی: JR_IJAS-55-1_010
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 255
نویسندگان
گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه کردستان، سنندج، ایران
گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه کردستان، سنندج، ایران
گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید باهنر کرمان، کرمان، ایران
گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه اراک، اراک، ایران
گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه کردستان، سنندج، ایران.
چکیده
شناسایی نشانههای انتخاب، اطلاعاتی در مورد مراحل تکامل گونههای مختلف از جمله گوسفند، که منجر به تغییراتی در سطح ژنوم آنها در طی سالیان متمادی میشود، را فراهم میکند. هدف از این پژوهش شناسایی نشانههای ژنومی انتخاب در گوسفندان مناطق مرتفع کشور ایران بود. بدین منظور ۵۸ راس گوسفند از ۴ نژاد که دو نژاد در مناطق مرتفع و دو نژاد در مناطق پست پراکندهاند، با استفاده از آرایههای گوسفندk ۶۰۰ تعیین ژنوتیپ شدند. جهت شناسایی نواحی ژنومی تحت انتخاب از دو آزمون آماری برآوردگر نااریب FST (تتا) و hapFLK استفاده شد. با استفاده از آزمون تتا، ۲۲ منطقه ژنومی به عنوان مناطق تحت انتخاب شناسایی شدند. در آزمون hapFLK نیز ۱۵ منطقه ژنومی شناسایی شد. تجزیه و تحلیل اطلاعات زیستی (بیوانفورماتیکی) نشان داد که برخی از این مناطق ژنومی با ژنهای موثر بر سازگاری با شرایط کم اکسیژنی (TXNDC۵)، خونسازی (FANCA)، ایمنیزایی و مقابله با عفونت (LEF۱، NMUR۱، PTMA و COPS۷B)، تنظیم فشار خون و پاسخ به درد و التهاب (NMUR۱) و سرکوب سرطان (CD۸۲، GAS۸، PRMT۱، B۳GNT۷ و ...) همپوشانی دارند. بررسی QTLهای گزارش شده نیز نشان داد که این مناطق با QTLهای صفات مهم اقتصادی از جمله صفات مرتبط با میانگین غلظت هموگلوبین گلبول های قرمز، هماتوکریت، مشخصات گوشت، لاشه، شیر، وزن بدن، تراکم استخوان و تعداد کل برههای متولد شده در ارتباط میباشند. با توجه به اینکه تحقیقات کمی در رابطه با سازگاری با ارتفاع در گوسفندان انجام شده است، لذا نتایج این تحقیق میتواند اطلاعات سودمندی در رابطه با ژنهایی که به سازگاری با ارتفاع پاسخ میدهند، ارایه دهد. به هر حال، به منظور شناسایی و بررسی دقیقتر جهشهای عامل در ژنها و QTLهای شناسایی شده ضروری است که پژوهشهای تکمیلی بیشتری صورت گیرد.کلیدواژه ها
آزمون FST, آزمون hapFLK, ارتفاع از سطح دریا, پویش ژنومی, نشانه های انتخاباطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.