ورود
مقالات فارسیISIکنفرانسهاژورنالها

شناسایی نواحی ژنومی تحت انتخاب مثبت برای سازگاری با ارتفاع بالا در گوسفندان ایرانی

محل انتشار: فصلنامه علوم دامی ایران، دوره: 55، شماره: 1
سال انتشار: 1403
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 117

فایل این مقاله در 20 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:
https://civilica.com/doc/2024669

شناسه ملی سند علمی:

JR_IJAS-55-1_010

تاریخ نمایه سازی: 19 تیر 1403

چکیده مقاله:

شناسایی نشانه­های انتخاب، اطلاعاتی در مورد مراحل تکامل گونه­های مختلف از جمله گوسفند، که منجر به تغییراتی در سطح ژنوم آنها در طی سالیان متمادی می­شود، را فراهم می­کند. هدف از این پژوهش شناسایی نشانه­های ژنومی انتخاب در گوسفندان مناطق مرتفع کشور ایران بود. بدین منظور ۵۸ راس گوسفند از ۴ نژاد که دو نژاد در مناطق مرتفع و دو نژاد در مناطق پست پراکنده­اند، با استفاده از آرایه­های گوسفندk ۶۰۰ تعیین ژنوتیپ شدند. جهت شناسایی نواحی ژنومی تحت انتخاب از دو آزمون آماری برآوردگر نااریب FST (تتا) و hapFLK استفاده شد. با استفاده از آزمون تتا، ۲۲ منطقه ژنومی به عنوان مناطق تحت انتخاب شناسایی شدند. در آزمون hapFLK نیز ۱۵ منطقه ژنومی شناسایی شد. تجزیه و تحلیل اطلاعات زیستی (بیوانفورماتیکی) نشان داد که برخی از این مناطق ژنومی با ژن­های موثر بر سازگاری با شرایط کم اکسیژنی (TXNDC۵)، خون­سازی (FANCA)، ایمنی­زایی و مقابله با عفونت (LEF۱، NMUR۱، PTMA و COPS۷B)، تنظیم فشار خون و پاسخ به درد و التهاب (NMUR۱) و سرکوب سرطان (CD۸۲، GAS۸، PRMT۱، B۳GNT۷ و ...) همپوشانی دارند. بررسی QTLهای گزارش شده نیز نشان داد که این مناطق با QTLهای صفات مهم اقتصادی از جمله صفات مرتبط با میانگین غلظت هموگلوبین گلبول های قرمز، هماتوکریت، مشخصات گوشت، لاشه، شیر، وزن بدن، تراکم استخوان و تعداد کل بره­های متولد شده در ارتباط می­باشند. با توجه به اینکه تحقیقات کمی در رابطه با سازگاری با ارتفاع در گوسفندان انجام شده است، لذا نتایج این تحقیق می­تواند اطلاعات سودمندی در رابطه با ژن­هایی که به سازگاری با ارتفاع پاسخ می­دهند، ارایه دهد. به هر حال، به منظور شناسایی و بررسی دقیق­تر جهش­های عامل در ژن­ها و QTLهای شناسایی شده ضروری است که پژوهش­های تکمیلی بیشتری صورت گیرد.

کلیدواژه ها:

نویسندگان

زهرا پتی آبادی

گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه کردستان، سنندج، ایران

محمد رزم کبیر

گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه کردستان، سنندج، ایران

علی اسمعیلی زاده کشکوئیه

گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید باهنر کرمان، کرمان، ایران

محمدحسین مرادی

گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه اراک، اراک، ایران

امیر رشیدی

گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه کردستان، سنندج، ایران.

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Adachi, M., Taki, T., leki, Y., Huang, C., HigasMyama, M. ...
  • Akey, J.M. (۲۰۰۹). Constructing genomic maps of positive selection in ...
  • Akey, J. M., Zhang, G., Zhang, K., Jin, L., & ...
  • Alberts, B. (۲۰۰۸). Molecular Biology of the Cell (۵th ed.). New ...
  • Barrett, J. C., Fry, B., Maller,j. & Daly, M. J. ...
  • Bidhendi, A. J., Altartouri, B., Gosselin, F. P., & Geitmann, ...
  • Biswas, S. & Akey, J. M. (۲۰۰۶). Genomic insights into ...
  • Bonhomme, M., Chevalet, C., Servin, B., Boitard, S., Abdallah, J., ...
  • Brighton, P. J., Szekeres, P. G. & Willars, G. B. ...
  • Büdinger, L., Hertl, M., & Büdinger, L. (۲۰۰۰). Immunologic mechanisms ...
  • Carroll, D. J., Burns, M. W., Mottram, L., Propheter, D. ...
  • Crow, T. J., & Kelman, G. R. (۱۹۷۳). Psychological effects ...
  • Dennis, J. W., Granovsky, M., & Warren, C. E. (۱۹۹۹). ...
  • Duran-Nebreda, S., Pla, J., Vidiella, B., Piñero, J., Conde-Pueyo, N., ...
  • Edea, Z., Dessie, T., Dadi, H., Do, K. T., & ...
  • Endo, M. (۲۰۰۶). Calcium ion as a second messenger with ...
  • Faramoushi, M., Amir Sasan, R., Sari Sarraf, V., & Karimi, ...
  • Fariello, M. I., Boitard, S., Naya, H., SanCristobal, M., & ...
  • Fededa, J. P., & Gerlich, D. W. (۲۰۱۲). Molecular control ...
  • Galardi, S., Fatica, A., Bachi, A., Scaloni, A., Presutti, C., ...
  • Gale, G. E., Torre-Bueno, J. R., Moon, R. E., Saltzman, ...
  • Gardner, J. L., Peters, A., Kearney, M., Joseph, L., & ...
  • Gebreselassie, G., Liang, B., Berihulay, H., Islam, R., Abied, A., ...
  • Gene Cards. http://www.genecards.org/cgi-bin/carddisp.pl?gene=STAT ...
  • Goldstein, A. L., & Goldstein, A. L. (۲۰۰۹). From lab ...
  • Gorkhali, N. A., Dong, K., Yang, M., Song, S., Kader, ...
  • Grossman, S. R., Shylakhter, I., Karlsson, E. K., Byrne, E. ...
  • Guen, V. J., Gamble, C., Flajolet, M., Unger, S., Thollet, ...
  • Hancock, A. M., Witonsky, D. B., Alkorta-Aranburu, G., Beall, C. ...
  • Hoffmann, I. (۲۰۱۰). Climate change in context: implications for livestock ...
  • Horna-Terrón, E., Pradilla-Dieste, A., Sánchez-de-Diego, C., & Osada, J. (۲۰۱۴). ...
  • Joost, S., Bonin, A., Bruford, M. W., Després, L., Conord, ...
  • Kageyama, T., Nagashio, R., Ryuge, S., Matsumoto, T., Iyoda, A., ...
  • Karell, P., Ahola, K., Karstinen, T., Valkama, J., & Brommer, ...
  • Kayserili, H., Uz, E., Niessen, C., Vargel, I., Alanay, Y., ...
  • Klose, C, S., Mahlakõiv, T., Moeller, J. B., Rankin, L. ...
  • Kreitman, M. (۲۰۰۰). Methods to detect selection in populations with ...
  • Latour, B. L., Van, De., Weghe, J. C., Rusterholz, T. ...
  • Li, J., Belogortseva, N., Porter, D., & Park, M. (۲۰۰۸). ...
  • Lobell, D. B., Burke, M. B., Tebaldi, C., Mastrandrea, M. ...
  • MacEachern, S., Hayes, B., McEwan, J., & Goddard, M. (۲۰۰۹). ...
  • Mastrangelo, S., Bahbahani, H., Moioli, B., Ahbara, A., Al Abri, ...
  • Mathioudaki, K., Papadokostopoulou, A., Scorilas, A., Xynopoulos, D., Agnanti, N., ...
  • McCormick, C., Duncan, G., Goutsos, K. T., & Tufaro, F. ...
  • McDownald, P. R., Edwards, J. F., Greenhalgh, D. & Morgan, ...
  • Mochida, G. H., Ganesh, V. S., De Michelena, M. I., ...
  • Mohammadi, H., Rafat, A., Moradi Shahre Babak, M. Shoja, J. ...
  • Mohammapdour R, Ghandehari H. (۲۰۲۲). Mechanisms of immune response to ...
  • Moon, R. E. (۲۰۰۵). Clinical care in altered environments: at ...
  • Moradi, M. H., Khaltabadi-Farahani, A. H., Khodaei-Motlagh, M., Kazemi-Bonchenari, M., ...
  • Moradi, M. H., Nejati-Javaremi, A., Moradi-Shahrbabak, M., Dodds, K. G., ...
  • Naggert, J. K., Fricker, L. D., Varlamov, O., Nishina, P. ...
  • Nasoori, A. (۲۰۲۰). Formation, structure, and function of extra‐skeletal bones ...
  • Nielsen, R. (۲۰۰۵). Molecular signature of natural selection. Annual Review ...
  • Oleksyk, T. K., Smith, M. W., & O'Brien, S. J. ...
  • Pan, W., Zhang, N., Liu, W., Liu, J., Zhou, L., ...
  • Panman, L., Drenth, T., Tewelscher, P., Zuniga, A., & Zeller, ...
  • Pavlidis, P., & Alachiotis, N. (۲۰۱۷). A survey of methods ...
  • Pfeffer, G., Gorman, G. S., Griffin, H., Kurzawa-Akanbi, M., Blakely, ...
  • Purcell, S., Neale, B., Todd-Brown, K., Thomas, L., Ferreira, M. ...
  • Qanbari, S., Pausch, H., Janse, S., Somel, M., Strom, T.M., ...
  • Rasmussen, H. (۱۹۸۵). Calcium Ion. InCalcium in biological systems, pp. ...
  • Ready, S. (۲۰۱۳). Abnormal Growth of the Parasite Toxoplasma Gondii ...
  • Ridder, K., Keller, S., Dams, M., Rupp, A. K., Schlaudraff, ...
  • Rossberg, W., Saternus, R., Wagenpfeil, S., Kleber, M., März, W., ...
  • Samuel, S., & Gary, W. (۲۰۱۱). Polar bodies—more a lack ...
  • Senniappan, S., Shanti, B., James, C., & Hussain, K. (۲۰۱۲). ...
  • Shi, H., Hudson, L. G., & Liu, K. J. (۲۰۰۴). ...
  • Sinha, N., Puri, P., Nairn, A. C., & Vijayaraghavan, S. ...
  • Steinke, F. C., & Xue, H. H. (۲۰۱۴). From inception ...
  • Stowell, S. R., Ju, T., & Cummings, R. D. (۲۰۱۵). ...
  • Tan, J., & Yang, L. (۲۰۱۸). Long noncoding RNA VPS۹D۱-AS۱ ...
  • Tischfield, M. A., Baris, H. N., Wu, C., Rudolph, G., ...
  • Tischkowitz, M. D., and Hodgson, S. V. (۲۰۰۳). Fanconi anaemia. ...
  • Torres, R., Croll, S. D., Vercollone, J., Reinhardt, J., Griffiths, ...
  • Wara, D. W., Goldstein, A. L., Doyle, N. E., & ...
  • Wei, P., Wang, H., Li, Y., & Guo, R. (۲۰۲۱). ...
  • Weir, B. S., & Cockerham, C. C. (۱۹۸۴). Estimating F-statistics ...
  • Wong, C. H. (۲۰۰۵). Protein glycosylation: new challenges and opportunities. ...
  • Wu, X., Jia, J., & You, H. (۲۰۱۵). Thymosin alpha-۱ ...
  • Xiaowei, W. A., & Qing, M. A. (۲۰۲۰). Genome-wide association ...
  • Yang, Y. (۲۰۰۹). Skeletal morphogenesis during embryonic development. Critical Reviews™ ...
  • Yang, Y. (۲۰۱۳). Skeletal morphogenesis and embryonic development. Primer on ...
  • Zhang, H., Li, S., Doan, T., Rieke, F., Detwiler, P. ...
  • Zhang, L., Hou, Y., Li, N., Wu, K., & Zhai, ...
    • نمایش کامل مراجع