مقایسه وابستگی اتصال ترکیبات سیاه دانه و شیرین بیان با رمدسیویر بر Mpro سارس کرونا ویروس۲ با استفاده از شبیه سازی دینامیک مولکولی هدایت شده
- سال انتشار: 1402
- محل انتشار: مجله مهندسی مکانیک دانشگاه تبریز، دوره: 53، شماره: 3
- کد COI اختصاصی: JR_TUMECHJ-53-3_019
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 88
نویسندگان
دانشجوی دکتری، گروه مهندسی مکانیک و هوافضا، دانشگاه حکیم سبزواری، سبزوار، ایران
کارشناسی ارشد، گروه مهندسی مکانیک و هوافضا، دانشگاه حکیم سبزواری، سبزوار، ایران
دانشیار، گروه مهندسی مکانیک و هوافضا، دانشگاه حکیم سبزواری، سبزوار، ایران
دانشیار، گروه مهندسی مکانیک و هوافضا، دانشگاه حکیم سبزواری، سبزوار، ایران
چکیده
سارس کرونا ویروس ۲ منجر به بیماری کووید-۱۹ به عنوان یک بیماری همهگیر توسط سازمان جهانی بهداشت (WHO) گزارش شده است. در این ویروس یکی از پروتئازهای سیستئین ضروری که پروتئاز اصلی نامیده میشود، هدف دارویی مناسبی برای بسیاری از مهارکننده های گیاهی و شیمیایی است. بررسی وابستگی اتصال مهارکنندهها به پروتئاز اصلی سارس کرونا ویروس۲ یکی از عوامل تاثیرگذار در کارایی آنهاست. در این مقاله وابستگی اتصال داروهای گیاهی ازجمله نیجلیدین از گیاه سیاهدانه و لیکوریتیژنین از گیاه شیرینبیان بر پروتئاز اصلی از سارس کرونا ویروس ۲ با استفاده از شبیهسازی دینامیک مولکولی هدایتشده موردبررسی قرارگرفته و با داروی شیمیایی رمدسیویر مقایسه شده است. نتایج نشان دادند که در بین لیگاندهای گیاهی، نیجلیدین بیشترین نیروی جداشدگی را به خود اختصاص میدهد. این امر در حالی است که رمدسیویر به عنوان یک مهارکننده شیمیایی دارای بیشترین نیروی جداشدگی در مقایسه با مهارکنندههای گیاهی است. همچنین انرژی الکترواستاتیک و واندروالس برای مجموعه رمدسیویر و پروتئاز اصلی نسبت به سایر مهارکنندههای گیاهی مقدار منفیتری را نشان میدهد. بنابراین باوجود امتیاز اتصال بالای ترکیبات سیاهدانه و شیرینبیان، رمدسیویر تحت عنوان یک ترکیب شیمیایی وابستگی اتصال بیشتری را نشان میدهد.کلیدواژه ها
سیاه دانه, شیرین بیان, پروتئاز اصلی, سارس کرونا ویروس ۲, مهارکننده, شبیه سازی دینامیک مولکولی هدایت شدهاطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.