Identification of Differentially ExpressedGenes and Dysregulated Pathways in Hepatocellular Carcinomathrough RNA-seq Analysis

سال انتشار: 1402
محل انتشار: اولین کنگره بین المللی ژنومیک سرطان
کد COI اختصاصی: CGC01_111
زبان مقاله: انگلیسی
تعداد مشاهده: 44

نویسندگان

Department of Genetics, Faculty of Biological Sciences, TarbiatModares University, Tehran, Iran

چکیده

Hepatocellular carcinoma (HCC) is a highly aggressive livercancer with limited treatment options. In this study, we performedRNA-seq analysis on HCC samples and adjacent nontumorliver tissues to identify differentially expressed genes(DEGs) and dysregulated pathways. We analyzed RNA-seqdata from ۱۷ HCC samples and ۱۷ adjacent tissue samples usingthe R/Bioconductor package DESeq۲. We identified morethan ۷۰۰۰ differentially expressed genes (DEGs) with a |foldchange| ≥۲ and an adjusted p-value ≤۰.۰۵. We then used theDAVID tool to perform functional annotation and enrichmentanalysis of the DEGs. To visualize the interactions among theDEGs and their associated pathways, we constructed a proteinproteininteraction (PPI) network using the Cytoscape software.Our findings provide new insights into the molecular mechanismsunderlying HCC and identify potential therapeutic targetsfor this disease.

کلیدواژه ها

Hepatocellular carcinoma, RNA-seq analysis, Pathwayanalysis, Protein-protein interaction network, Therapeutictargets

اطلاعات بیشتر در مورد COI

COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.

کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.