آنالیز بیوانفورماتیکی برای پیش بینی میکرو RNA های بالقوه مهارکننده فرایندهای رگزایی در سرطان

  • سال انتشار: 1395
  • محل انتشار: مجله دانشگاه علوم پزشکی گرگان، دوره: 19، شماره: 1
  • کد COI اختصاصی: JR_GOUMS-19-1_013
  • زبان مقاله: فارسی
  • تعداد مشاهده: 224
دانلود فایل این مقاله

نویسندگان

فاطمه طرقی

M.Sc in Cell and Molecular Biology, Department of Drug Affairs- Bostanabad, Tabriz University of Medical Sciences, Bostanabad, Iran

یعقوب طرقی

M.Sc in Parasitology, Tabriz University of Medical Sciences, Laboratory of Hashtrood, Hashtrood, Iran

چکیده

زمینه و هدف : با افزایش اندازه تومور، محیط سلولهای توموری هیپوکسیک و اسیدیک شده و سلول ها شروع به افزایش تولید چندین نوع عامل رشد میکنند که در نتیجه آن تشکیل رگهای خونی موضعی آغاز میشود. به دنبال آن متاستاز سلول های سرطانی از طریق عروق خونی اتفاق می افتد، لذا مهار رگزایی می تواند روش جدیدی برای درمان سرطان باشد. این مطالعه به منظور آنالیز بیوانفورماتیکی برای پیش بینی میکرو RNA های بالقوه مهارکننده فرایندهای رگزایی در سرطان انجام گردید. روش بررسی : در این مطالعه توصیفی میکرو RNA هایی با قابلیت اتصال به ژن های MMP دخیل در رگزایی تومور (MMP۱-۲-۳-۸-۹-۱۰-۱۱-۱۳) با استفاده از پایگاه داده mirwalk شناسایی گردید. انتخاب micro RNA های موثر براساس تعداد جایگاه اتصال آنها به ۳'UTR ژن ها انجام شد. برای تعیین توالی مکمل ژن نمونه با micro RNA های منتخب از پایگاه داده Microrna استفاده گردید. یافته ها : بیشترین تعداد جایگاه اتصال به ژن های دخیل در رگزایی تومور mir-۱۳۰۲ ، mir-۵۱۶a ، mir-۵۱۲ ، mir-۵۱۱ ، mir-۵۱۶b و mir-۵۴۸ تعیین شد. نتیجه گیری : micro RNA ها گزینه های مناسبی برای کشت سلولی و بررسی آزمایشگاهی به منظور یافتن راه های جدید پیشگیری از پیشرفت سرطان از طریق مهار رگزایی هستند.

کلیدواژه ها

Bioinformatics, Angiogenesis, MMPs, MicroRNA, بیوانفورماتیک, رگزایی, ماتریکس متالوپروتئیناز, micro RNA

اطلاعات بیشتر در مورد COI

COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.

کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.