پروفایل ترانسکریپتومی اندومتریوم برای رشد و طویل شدگی رویان گاوهای شیری

  • سال انتشار: 1399
  • محل انتشار: مجله تحقیقات تولیدات دامی، دوره: 9، شماره: 2
  • کد COI اختصاصی: JR_ARGU-9-2_001
  • زبان مقاله: فارسی
  • تعداد مشاهده: 204
دانلود فایل این مقاله

نویسندگان

جعفر جمعدار زنوزق

دانشجوی دکتری، گروه علوم دامی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه تهران

محمد مرادی شهربابک

استاد، گروه علوم دامی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه تهران

اردشیر نجاتی جوارمی

استاد، گروه علوم دامی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه تهران

چکیده

در تحقیق حاضر، به منظور شناسایی ژن های درگیر در طویل شدگی رویان گاوهای شیری، شناسایی آثار متقابل بین ژنی و واکاوی ماژول­های مهم و عملکردی در طول این فرآیند از داده های ترانسکریپتومی استفاده شد. رشد، تکوین موفقیت آمیز رویان و زنده مانی آن یکی از مهم ترین نیازهای اساسی در صنعت گاو شیری است. بخش بزرگی از آبستنی های از دست رفته در طول هفته های اولیه و به ویژه در گام طویل شدگی رویان اتفاق می افتد. بدین ترتیب برای درک بهتر اساس مولکولی این فرآیند، پروفایل یاخته ای اندومتریوم رحمی گاوهای آبستن در طول رشد و مرحله طویل شدگی رویان در مقایسه با گاوهای غیرآبستن بررسی شد. بعد از پردازش و تجزیه داده های ریزآرایه و RNA-Seq و ترکیب نتایج حاصل، آثار متقابل بین ژنی با استفاده از روش داده کاوی مورد بررسی قرار گرفت. در نهایت با مقایسه پروفایل اندومتریوم و بازسازی شبکه و جستجوی ماژول های مهم، شمار چهار ماژول عملکردی معنی دار شناسایی شد. مهم ترین ژن های موجود شامل ANKRD۵۴، ADAMDEC۱، PTN، MT۱A، LIMS۲، MT۱E، CPA۳ وMTPN  بودند. بر اساس این تحقیق توصیه می شود ماژول های شناسایی شده می توانند نشانگرهای مناسبی برای رشد، طویل شدگی، تکوین، ترشح مایع مجرای رحمی، پاسخ ایمنی و زنده مانی رویان باشند.

کلیدواژه ها

بلاستوسیست, شبکه ژنی, گاو آبستن, ماژول

اطلاعات بیشتر در مورد COI

COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.

کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.