تحلیل انطباق پذیری تنوع ژرم پلاسم فندق شمالغرب ایران بر اساس صفات کیفی و نشانگر ژنتیکی ناحیه کدون آغاز ATG (SCoT)
- سال انتشار: 1401
- محل انتشار: مجله تازه های بیوتکنولوژی سلولی – مولکولی، دوره: 12، شماره: 48
- کد COI اختصاصی: JR_NCMBJ-12-48_006
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 152
نویسندگان
Departement of Horticulture ,Faculty of Agriculture, Miyaneh Branch, Islamic Azad University, Miyaneh ,Iran
Department of Horticulture, Medicinal Plants and Organic Products Research Center, Miyaneh Branch, Islamic Azad University, Miyaneh, Iran
Department of Agronomy and Plant Breeding, Faculty of Agriculture, Shahed University, Tehran, Iran
Deparment of Argonomy and Plant Breeding, Miyaneh Branch, Islamic Azad University, Miyaneh, Iran
Medicinal Plant Research Center, Institute of Medicinal Plants, ACECR, Karaj, Iran
چکیده
سابقه و هدف: ارزیابی تنوع ژنتیکی ژرم پلاسمی طبیعی و حفاظت شده از راهبردیترین فعالیتهای جهانی و بهعنوان سرمایه ملی هر کشور است. بهطوریکه در طول سالیان متمادی جهشها و تلاقیهای مختلف باعث تجمع برخی ژنهای مفید در این ژرم پلاسمها شده و میتواند بهعنوان ذخایر ژنتیکی در مواقع بحرانی مورد استفاده قرار گیرد. ارزیابی تنوع بر اساس صفات مورفولوژیکی و فنوتیپی بهدلیل تاثیر محیط و اثر متقابل ژنوتیپ در محیط پایداری مناسبی ندارد. بنابراین استفاه از نشانگرهای مبتنیبر DNA که تکرارپذیری بالایی دارد. نشانگر مبتنیبر امپلیکون DNA ناحیه شروع کدون برای ترجمه SCoT در گیاهان بهدلیل وراثتپذیری و تکرارپذیری، بهتازگی مورد استفاده قرار گرفته است. هدف از این پژوهش ارزیابی تنوع ژنتیکی ژرم پلاسمهای ذخیرهگاه ژنتیکی فندق در رگههای جنگلی شمالغرب کشور با استفاده نشانگر مولکولی SCoTو به روش PCR انطباقپذیری آن با تنوع صفات کیفی بر اساس نشانگرهای ملی آزمونهای تمایز فندق است. مواد و روشها: در این تحقیق ۷۷ ژنوتیپ از جنگلهای فندق اردبیل، میانه و ارسباران انتخاب و محل هر ژنوتیپ با استفاده از GPS نشانهگذاری شد. با استفاده از دستورالعمل ملی آزمونهای تمایز یکنواخت و پایداری فندق، صفات کیفی ارزشگذاری شد و پس از استخراج DNA از برگ آنها با استفاده از ۱۵ پرایمر اختصاصی SCoT تنوع پلیمورفیسم آنها ارزیابی شد. یافته ها: نتایج نشان دادند که ژنوتیپها از نظر صفات کیفی تمایز به ۱۷ کلاستر طبقهبندی شدند. با استفاده از ۱۵ نشانگر SCoT تعداد نوارهای چند شکل ۱۶۵ نوار با میانگین ۱۱ نوار برای هر نشانگر و میانگین درصد پلیمورفیسم با میانگین ۱۱ نوار برای هر نشانگر و میانگین درصد پلیمورفیسم برای نشانگر % ۲/۹۰ ژنوتیپها بر اساس این نشانگرها در ۱۹ زیر کلاستر گروهبندی شدند. بحث: آنالیز صفات کیفی بر اساس نوارهای ایجاد شده در SCoT نشان دادند که نشانگرهای ۳، ۵، ۱۱، ۱۲، ۱۸ و ۲۰ دارای تنوع ژنتیکی بیشتر و معنیدار بودند که میزان انطباق گروهبندی ژنوتیپها بر اساس SCoT نشانگرها ۸۷/۰ بر اساس آزمون مانتل برآورد گردید. نتیجه گیری: با استفاده از دو نشانگر ژنتیکی میتوان (%۷۵=R۲) از تنوع دیسکریپتورهای تمایز فندق دسترسی پیدا نمود.کلیدواژه ها
SCoT marker, genetic diversity, hazelnut, northwest of Iran, Iau Science., نشانگرSCoT, تنوع ژنتیکی, فندق, شمال غرب ایران, .Iau Scienceاطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.