تحلیل انطباق پذیری تنوع ژرم پلاسم فندق شمالغرب ایران بر اساس صفات کیفی و نشانگر ژنتیکی ناحیه کدون آغاز ATG (SCoT)
سال انتشار: 1401
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 148
فایل این مقاله در 12 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_NCMBJ-12-48_006
تاریخ نمایه سازی: 18 دی 1401
چکیده مقاله:
سابقه و هدف: ارزیابی تنوع ژنتیکی ژرم پلاسمی طبیعی و حفاظت شده از راهبردیترین فعالیتهای جهانی و بهعنوان سرمایه ملی هر کشور است. بهطوریکه در طول سالیان متمادی جهشها و تلاقیهای مختلف باعث تجمع برخی ژنهای مفید در این ژرم پلاسمها شده و میتواند بهعنوان ذخایر ژنتیکی در مواقع بحرانی مورد استفاده قرار گیرد. ارزیابی تنوع بر اساس صفات مورفولوژیکی و فنوتیپی بهدلیل تاثیر محیط و اثر متقابل ژنوتیپ در محیط پایداری مناسبی ندارد. بنابراین استفاه از نشانگرهای مبتنیبر DNA که تکرارپذیری بالایی دارد. نشانگر مبتنیبر امپلیکون DNA ناحیه شروع کدون برای ترجمه SCoT در گیاهان بهدلیل وراثتپذیری و تکرارپذیری، بهتازگی مورد استفاده قرار گرفته است. هدف از این پژوهش ارزیابی تنوع ژنتیکی ژرم پلاسمهای ذخیرهگاه ژنتیکی فندق در رگههای جنگلی شمالغرب کشور با استفاده نشانگر مولکولی SCoTو به روش PCR انطباقپذیری آن با تنوع صفات کیفی بر اساس نشانگرهای ملی آزمونهای تمایز فندق است.
مواد و روشها: در این تحقیق ۷۷ ژنوتیپ از جنگلهای فندق اردبیل، میانه و ارسباران انتخاب و محل هر ژنوتیپ با استفاده از GPS نشانهگذاری شد. با استفاده از دستورالعمل ملی آزمونهای تمایز یکنواخت و پایداری فندق، صفات کیفی ارزشگذاری شد و پس از استخراج DNA از برگ آنها با استفاده از ۱۵ پرایمر اختصاصی SCoT تنوع پلیمورفیسم آنها ارزیابی شد.
یافته ها: نتایج نشان دادند که ژنوتیپها از نظر صفات کیفی تمایز به ۱۷ کلاستر طبقهبندی شدند. با استفاده از ۱۵ نشانگر SCoT تعداد نوارهای چند شکل ۱۶۵ نوار با میانگین ۱۱ نوار برای هر نشانگر و میانگین درصد پلیمورفیسم با میانگین ۱۱ نوار برای هر نشانگر و میانگین درصد پلیمورفیسم برای نشانگر % ۲/۹۰ ژنوتیپها بر اساس این نشانگرها در ۱۹ زیر کلاستر گروهبندی شدند.
بحث: آنالیز صفات کیفی بر اساس نوارهای ایجاد شده در SCoT نشان دادند که نشانگرهای ۳، ۵، ۱۱، ۱۲، ۱۸ و ۲۰ دارای تنوع ژنتیکی بیشتر و معنیدار بودند که میزان انطباق گروهبندی ژنوتیپها بر اساس SCoT نشانگرها ۸۷/۰ بر اساس آزمون مانتل برآورد گردید.
نتیجه گیری: با استفاده از دو نشانگر ژنتیکی میتوان (%۷۵=R۲) از تنوع دیسکریپتورهای تمایز فندق دسترسی پیدا نمود.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
مهران اوچی اردبیلی
Departement of Horticulture ,Faculty of Agriculture, Miyaneh Branch, Islamic Azad University, Miyaneh ,Iran
حسن نورافکن
Department of Horticulture, Medicinal Plants and Organic Products Research Center, Miyaneh Branch, Islamic Azad University, Miyaneh, Iran
حسنعلی نقدی بادی
Department of Agronomy and Plant Breeding, Faculty of Agriculture, Shahed University, Tehran, Iran
ناصر محبعلی پور
Deparment of Argonomy and Plant Breeding, Miyaneh Branch, Islamic Azad University, Miyaneh, Iran
اردشیر قادری
Medicinal Plant Research Center, Institute of Medicinal Plants, ACECR, Karaj, Iran
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :