مدل های بیزی در انطباق پروتئین ها
- سال انتشار: 1394
- محل انتشار: مجله علوم آماری، دوره: 9، شماره: 2
- کد COI اختصاصی: JR_STAT-9-2_007
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 151
نویسندگان
Department of Statistics, Shahid Beheshti University, Tehran, Iran.
Department of Statistics, Tarbiat Modares University, Tehran, Iran.
Department of Statistics, Shahid Beheshti University, Tehran, Iran.
چکیده
در این مقاله راه حل های احتمالاتی مسئله انطباق ساختار سوم پروتئین و تفاوت آن با الگوریتم های قطعی مطالعه و بررسی می شود. برای این منظور دو مدل احتمال بیزی معرفی و راه حلی در خصوص اضافه کردن اطلاعات توالی و نوع اسید آمینه (ساختار اول) به آن ارائه خواهد شد. همچنین نحوه برآورد پارامترهای انطباق به کمک الگوریتم مونت کارلوی زنجیر مارکف و نمونه گیری از توزیع پسین معرفی می شود. در نهایت نحوه کاربست این روش ها در انطباق پروتئین ها نشان داده شد و برآورد پارامترها در مدل های متفاوت برای یک مجموعه داده واقعی ارزیابی و مقایسه خواهد شد.کلیدواژه ها
Statistical Shape Analysis, Size-and-shape Distance, Bioinformatics, Structural Alignment of Protein, Tertiary Structure of Protein, Bayesian Inference, آمار شکل, فاصله اندازه شکل, بیوانفورماتیک, انطباق ساختاری پروتئین, ساختار سوم پروتئین, استنباط بیزیاطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.