ارزیابی تنوع ژنتیکی و روابط بین صفات با استفاده از ویژگی های زراعی و نشانگرهای مولکولی در ارقام جو
- سال انتشار: 1392
- محل انتشار: فصلنامه علوم زراعی ایران، دوره: 15، شماره: 1
- کد COI اختصاصی: JR_AGRO-15-1_005
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 294
نویسندگان
پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران
پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران
پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران
پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران
پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران
چکیده
در این تحقیق تنوع ژنتیکی ۲۴ رقم جو با استفاده از صفات زراعی، مورفولوژیکی و مولکولی مورد مطالعه قرار گرفت. سیزده صفت زراعی و مورفولوژیک در سال زراعی ۸۹-۱۳۸۸ در مزرعه تحقیقاتی دانشکده کشاورزی دانشگاه تهران مورد ارزیابی قرار گرفتند. بررسی تنوع ژنتیکی ومولکولی بین ارقام با استفاده از ۱۰ جفت آغازگر SSR صورت گرفت. نتایج تجزیه واریانس صفات کمی نشان داد که بین همه ارقام از نظر کلیه صفات، تفاوت معنی داری وجود داشت که نشان دهنده تنوع ژنتیکی بالا برای صفات مورد بررسی در بین ژنوتیپ ها بود. عملکرد دانه همبستگی مثبت و معنی داری با صفات تعداد گره در ساقه، ارتفاع بوته، وزن هزار دانه و تعداد پنجه در بوته داشت. تجزیه به مولفه های اصلی،۱۳ متغیر اولیه را در قالب چهار مولفه اصلی گروهبندی نمود که در مجموع ۹۲/۷۵ درصد از تغییرات کل را توجیه نمودند. براساس صفات کمی ارقام جو به سه گروه تقسیم شدند. ارقام گروه اول مربوط به مناطق گرمسیری و ارقام گروه دوم مربوط به مناطق سردسیر کشور بودند. اگرچه برخی از ارقام با عادت رشدی مشابه در کنار هم قرار گرفتند، ولی گروه بندی ارقام نتوانست آنها را از نظر عادت رشد از یکدیگر تفکیک نماید. تنوع مولکولی ارقام با استفاده از پارامترهای محتوای اطلاعات چند شکلی، تعداد آلل موثر و شاخص شانون اندازه گیری شد و میانگین ۳/۴۳ نوار SSR به دست آمدکه از این میان ۴/۳۱ نوار چند شکل بودند. متوسط تعداد نوار های چند شکلی از ۹/۱ تا ۰/۴ برای هر آغازگر متغیر بود. بیشترین نوار چند شکل مربوط به آغازگر Bmac۰۰۴۰ با ۰/۴ نوار و کمترین آن مربوط به آغازگرBmag۰۰۱۳ با ۹/۱ نوار بود. متوسط بیشترین نوار (۸/۴) مربوط به ارقام جنوب و گوهر جو و کمترین نوار (۸/۳) مربوط به رقم ریحان۰۳ بود. رقم گوهر جو با ۸۱ درصد چند شکلی در مجموع نوارهای مشاهده شده دارای بیشترین تنوع و رقم فجر۳۰ با ۵۴ درصد چند شکلی کمترین تنوع را داشتند. بر اساس شاخص شانون، تعداد آلل موثر و میزان اطلاعات چند شکلی تنوع ژنتیکی در ارقام بینابین بیشتر از ارقام بهاره بود. گروه بندی داده های مورفولوژیکی با داده های مولکولی مطابقت نداشتند. این موضوع نشان می دهد که نشانگرهای SSR مورد استفاده ارتباط ژنتیکی و پیوستگی با مکان های کنترل کننده صفات مورفولوژیکی مورد مطالعه نداشتند. با توجه به اینکه نشانگرهای SSR عمدتا در نواحی غیر کد کننده ژنوم قرار دارند، عدم ارتباط بین گروه بندی داده های مولکولی با داده های مورفولوژیکی دوراز انتظار نیست.کلیدواژه ها
Barley, Effective allele, Genetic diversity, Principal component analysis and SSR markers., آلل موثر, تنوع ژنتیکی, جو, مولفه های اصلی و نشانگرهای SSR.اطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.