ارزیابی روابط فیلوژنتیکی مولکولی ژن ACC در جنس های Hordeum، Leymus و Elymus

  • سال انتشار: 1391
  • محل انتشار: فصلنامه علوم زراعی ایران، دوره: 14، شماره: 1
  • کد COI اختصاصی: JR_AGRO-14-1_007
  • زبان مقاله: فارسی
  • تعداد مشاهده: 195
دانلود فایل این مقاله

نویسندگان

مرجان بهزادی راد

پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران

محمدرضا نقوی

پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران

علیرضا طالعی

پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران

چکیده

ژن تک نسخه پلاستیدی استیل کوآنزیم آ، اولین عامل کاتالیزی در بیوسنتز اسیدهای چرب، در مطالعه روابط فیلوژنتیکی، تکاملی و سیستماتیکی گندمیان توانایی زیادی دارد. احتمال اینکه، ژن های تک نسخه و کم نسخه دستخوش تکامل گروهی شوند کم است، بنابراین ACC ژن مهمی جهت مطالعه مبدا و تکامل پلی پلوییدها محسوب می شود. در این تحقیق رابطه فیلوژنتیکی هفت گونه و زیرگونه ی جو های بومی ایران، (Hudson Hordeum marinum)، (Hordeum brevisubulatum Trinus Link )، (Hordeum bulbosom L.)، (K. Koch Hordeum spontaneum)، جو زراعی دو ردیفه (Hordeum vulgare convar. distichon L.)، جو زراعی شش ردیفه (convar. hexastichon L. Hordeum vulgare)، با استفاده از آغازگر اختصاصی ژن استیل کوآنزیم آ کربوکسیلازACC۱ بررسی و توالی های بدست آمده از جو با توالی گونه هایی از جنس Leymus و Elymus موجود در پایگاه اطلاعاتی مقایسه شدند. نتایج نشان داد که جوهای بومی ایران تنوع زیادی داشتند. درخت فیلوژنتیکی نمونه ها را به دو گروه اصلی تقسیم نمود که اولین گروه شامل تمامی نمونه های جنس Leymus و Elymus و دو گونه از جنس Hordeum بود، در حالی که گروه دوم شامل گونه ها و زیرگونه-های Hordeum ایرانی همراه با Hordeum vulgare بود که مبدا آن شناخته شده نیست. نتایج حاصل از درخت فیلوژنتیکی در این تحقیق با نتایج سایر مطالعات بدست آمده از تحقیقات مورفولوژیکی و مولکولی مطابقت داشت. از آنجایی که ژن ACC۱ منبع ارزشمندی جهت تجزیه و تحلیل فیلوژنتیکی در طایفه Triticeae می باشد، لذا نتایج این تحقیق وضعیت ژنومی گونه ها و روابط تکاملی بین آنها و همچنین روابط منطقی تاکسونومی گونه های مهم و بومی جو ایران با استفاده از مقایسه توالی های DNA برای ژن مورد نظر را به خوبی مشخص نمود.

کلیدواژه ها

ACC gene, Gene sequence, Hordeum, Molecular evolution and Phylogenetic., تکامل مولکولی, توالی ژن, ژنACC, فیلوژنتیک و Hordeum

اطلاعات بیشتر در مورد COI

COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.

کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.