شناسایی ژن های میتوکندریایی تاثیر گذار بر تکامل سلول تخم تحت هورمون FSH با استفاده از داده های ریز آرایه در گاو
- سال انتشار: 1399
- محل انتشار: فصلنامه پژوهشهای علوم دامی ایران، دوره: 12، شماره: 2
- کد COI اختصاصی: JR_JASR-12-2_001
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 136
نویسندگان
کشاورزی و منابع طبیعی رامین خوزستان
دانشگاه کشاورزی و منابع طبیعی رامین خوزستان
دانشگاه کشاورزی و منابع طبیعی رامین خوزستان
دانشگاه کشاورزی و منابع طبیعی رامین خوزستان
دانشگاه کشاورزی و منابع طبیعی رامین خوزستان
چکیده
بلوغ تخمک شامل بلوغ هستهای و سیتوپلاسمی است که هر دو برای لقاح و نمو رویان اهمیت دارد. برخلاف بلوغ هستهای، بلوغ سیتوپلاسمی اووسیت را نمیتوان به راحتی ارزیابی کرد. با توجه به توزیع مجدد برخی اندامکها از جمله میتوکندری در زمان بلوغ میتوان آن را به عنوان شاخص بلوغ سیتوپلاسمی در نظر گرفت. در این مطالعه به منظور بررسی اثر هورمون FSH در شرایط آزمایشگاهی بر چگونگی بیان ژنهای میتوکندریایی، دادههای ریزآرایه حاوی اطلاعات بیان ژن سلولهای اووسیت گاو، با کد دسترسی GEO ( (GSE۳۸۳۴۵ استفاده گردید. آنالیز و مقایسه بیان ژنها در دو حالت قبل و بعد از بلوغ به ترتیب (۲۰ و ۹۶ ساعت بعد از تیمار) با استفاده از لینک نرمافزاری GEO۲R، دو گروه ژنهای افزایش و کاهش بیان یافته را تعیین نمود. برهمکنش گروههای ژنی با استفاده از پایگاه اطلاعاتی string، مجسمسازی شبکه با استفاده از نرمافزار cytoscape و هستیشناسی شبکه با استفاده از پایگاه اطلاعاتی comparative GO انجام گردید. در شبکه برهمکنش پروتئینی مربوط به ژنهای افزایش بیان یافته، ژنهای مهمMRPS۱۰ ، MRPS۱۸A، MRPL۱۶ و MRPL۱۷ که در فرایندهای انهدام میتوکندری و ترجمه ژنهای این اندامک و در شبکه ژنهای کاهش بیان یافته، ژنهایMRPL۲۲، ATP۵Bو ATP۵C۱که با کاهش بیان خود، سعی در ایجاد تعادل در مسیرهای مرتبط با انهدام میتوکندری و تولید ATP از طریق نقش در ساختار ATP سنتتاز، داشتند. در این مطالعه ژنهای تنظیم کننده و همچنین مسیرهای بیولوژیکی موثر به منظور درک ساز و کار اثر هورمون FSH بر روند بلوغ اووسیت از طریق اندامک میتوکندری بررسی گردیده است.کلیدواژه ها
تکامل سلول تخم, داده های ریز آرایه, ژن های میتوکندریایی, هورمون FSHاطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.