بررسی تراکم چندشکلی های تک نوکلئوتیدی (اسنیپ) موثر بر دنبه گوسفند
- سال انتشار: 1400
- محل انتشار: یازدهمین همایش سراسری محیط زیست، انرژی و منابع طبیعی پایدار
- کد COI اختصاصی: ECONF11_222
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 209
نویسندگان
دانشجوی کارشناسی ارشد، دانشگاه منابع کشاورزی و منابع طبیعی خوزستان
استاد گروه عوم دامی دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی خوزستان
استاد گروه عوم دامی دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی خوزستان
استادیار گروه عوم دامی دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی خوزستان
دانشیار گروه عوم دامی دانشگاه اراک
چکیده
نژادهای مختلفی از گوسفندان با فنوتیپ مختلف از نظر دنبه، در اثر انتخاب طبیعی و مصنوعی پس از اهلی شدن گوسفند ایجاد شدهاند. هدف این پژوهش، یافتن بخشهای مختلف ژنوم گوسفند که بر تشکیل دنبه موثرند میباشد. از تراشه های ۵۰K اسنیپ شرکت ایلومینا برای تعیین ژنوتیپ گوسفندان موجود در فاز اول پروژه هپ مپ استفاده شد. فنوتیپ گوسفندان بر اساس بود و نبود دنبه به صورت ۰ و ۱ کدگذاری شد. رگرسیون خطی برای پی بردن به اسنیپ های موثر بر فنوتیپ به کار گرفته شد و نتایج به صورت -Log Pvalue در قالب نمودار منهتن ارائه شد. با تصحیح بنفرونی سطح ۰,۰۰۰۰۰۱ بعنوان سطح معنی داری تعیین شد. تصحیح ساختاری انجام نشد تا تمامی اسنیپ های موثر ولی با اندازه کم بر اساس مدل بینهایت لوکوس با اثر کم دیده شوند. یافته های پژوهش حاکی از آن است که کروموزوم های یک، دو و سه بیشترین اسنیپ موثر بر تشکیل دنبه را داشته اند. اسنیپ های s۰۳۶۸۶,۱ در کروموزوم ۲۵ و اسنیپ OARX_۶۳۵۷۱۷۸۹.۱ در کروموزوم ۲۷ تاثیر بیشتری در ایجاد دنبه داشته اند. نتایج این پژوهش می تواند به اصلاح گران برای کنترل اندازه دنبه و به متخصصین پزشکی برای درک مکانیسم رسوب چربی در بدن انسان کمک کند.کلیدواژه ها
دنبه، اسنیپ، ایلومینا، پروژه هپ مپمقالات مرتبط جدید
اطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.