شناسایی و ردیابی Phytophthora erythroseptica و دورگ های آن با استفاده از آغازگرهای اختصاصی
- سال انتشار: 1398
- محل انتشار: فصلنامه بیماریهای گیاهی، دوره: 55، شماره: 3
- کد COI اختصاصی: JR_IJPP-55-3_006
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 95
نویسندگان
-
-
-
چکیده
گونهیPhytophthora erythroseptica ، عامل پوسیدگی صورتی سیبزمینی، یکی از اامیستهای بیماریزای گیاهی است که خسارت اقتصادی قابل توجهی را در مزرعه و انبار وارد میکند. به منظور شناسایی و ردیابی دقیق و حساس P. erythroseptica ، شش توالی هستهای و میتوکندریایی برای طراحی آغازگرهای اختصاصی مورد بررسی قرار گرفت. به دلیل شباهت زیاد توالیهای P. erythroseptica به خویشاوندان نزدیکش، تنها یک توالی هستهای (TigA) برای طراحی آغازگرهای اختصاصی مناسب تشخیص داده شد. با استفاده از آغازگرهای اختصاصی طراحی شده، شیوهای از واکنش زنجیرهای ساده و تودرتو برای شناسایی و ردیابی P. erythroseptica ابداع شد. اختصاصیت آغازگرهای طراحی شده با استفاده از مجموعهای از گونههای فیتوفتورا متعلق به تبارهای فیلوژنتیکی مختلف و نیز خویشاوندان نزدیک P. erythroseptica ارزیابی شد. ردیابی P. erythroseptica در دیانای خالص بیمارگر و دیانای استخراج شده از بافتهای گیاهی آلوده شامل سیبزمینی، گوجهفرنگی و اسفناج با استفاده از آغازگرها با موفقیت انجام شد. آغازگرهای اختصاصی۱۰ پیکوگرم از دیانای خالص P. erythroseptica را در واکنش زنجیرهای پلیمراز ساده ردیابی کردند، با این حال واکنش زنجیرهای پلیمراز تودرتو، حساسیت آغازگرها را حداقل صد برابر افزایش داد. همچنین، آغازگرهای اختصاصی قادر به ردیابی P. erythroseptica به عنوان والد پدری یا مادری در جدایههای دورگ بودند؛ این ویژگی به شناسایی یکی از والدین در دورگهای P. erythroseptica کمک شایانی میکندکلیدواژه ها
: اامیکوتا, پوسیدگی صورتی سیب زمینی, واکنش زنجیره ای پلیمرازاطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.