شناسایی و بررسی بیان ژن های HvPIP۱;۴ و HvnsLTP دخیل در تحمل به تنش خشکی در جو
- سال انتشار: 1398
- محل انتشار: مجله فرآیند و کارکرد گیاهی، دوره: 8، شماره: 30
- کد COI اختصاصی: JR_JISPP-8-30_023
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 209
نویسندگان
Lorestan University
Lorestan University
Lorestan University
Shiraz University
چکیده
مطالعه سازوکارهای تحمل تنش در گیاه جو، میتواند به درک بهتر اساس ژنتیکی تحمل به تنش خشکی کمک کند و در نهایت به بهبود خصوصیات ژنتیکی مرتبط با تحمل به تنش خشکی از طریق روشهای نوین ژنتیک مولکولی منجر شود. به منظور شناسایی و بررسی بیان ژنهای درگیر در تحمل به تنش خشکی گیاه جو، تجزیه و تحلیل ESTهای برگ و ریشه در ژنوتیپ های اسپانتانئوم (جو وحشی) و رقم زراعی نیمروز (متحمل در برابر تنش خشکی) صورت گرفت. اطلاعات اولیه کتابخانهها از پایگاههای جهانی دریافت گردید، سپس پیش پردازش دادهها و شناسایی ژنهای مرتبط با بیان متفاوت در بین کتابخانه ها، به کمک نرم افزارهای بیوانفورماتیک متعددی صورت گرفت. به منظور بررسی بیان ژنهای کاندید با استفاده از روش Real time-PCR، یک آزمایش به صورت فاکتوریل در قالب طرح کاملا تصادفی با سه تکرار روی ژنوتیپها به عنوان عامل اول و تیمار آبیاری (شاهد و آبیاری در۵۰ درصد FC) به عنوان عامل دوم در گلدان صورت گرفت. همچنین عامل زمان نمونه برداری نیز در سه سطح صفر، ۲۴ و ۷۲ ساعت پس از اعمال تنش خشکی لحاظ شد. بر اساس میزان بیان ژن در شرایط تنش، دو ژن به نام های HvPIP۱;۴ (Plasma Membrane Intrinsic Protein ۱;۴) و HvnsLTP (Non-Specific Lipid Transport; nsLTP) به عنوان ژنهای مهم درگیر در پاسخ به تنش خشکی در جو شناسایی شدند. بر اساس نتایج حاصل از بررسی بیان این ژنها مشخص گردید که ژنوتیپ نیمروز به عنوان رقم متحمل از بیان بالاتری برای ژنهای کاندید برخوردار بود، به طوری که ژنهای PIP۱;۴ و nsLTP به ترتیب یک افزایش ۹۸/۹۵ و ۵۴/۵۳ برابری بعد از ۷۲ ساعت نسبت به شرایط شاهد از خود نشان دادند. بهعلاوه، نتایج این مطالعه نشان داد که تغییرات میزان بیان ژن PIP۱;۴ در مقایسه با ژن HvnsLTPجو در ژنوتیپ متحمل نیمروز بطور معنیداری (P< ۰.۰۵) بیشتر از ژنوتیپ اسپانتانئوم بود. از آنجایی که این ژن حرکت آب و مواد محلول غیر باردار و دارای جرم مولکولی پایین را از شامههای پلاسمایی و تونوپلاست تسهیل میکند، این ژن احتمالا در روند تحمل به تنش خشکی نقش داشته باشد.کلیدواژه ها
Aquaporin, Bioinformatics Analysis, Gene Network, Plasma membrane, آکواپورین, تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیکی, شبکه ژنی, غشاء پلاسماییاطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.