پایگاه های داده های اصلی جهت مطالعه بیان ژن ها در گیاهان (مطالعه موردی: برنج)
- سال انتشار: 1398
- محل انتشار: فصلنامه تحقیقات غلات، دوره: 9، شماره: 1
- کد COI اختصاصی: JR_CRGU-9-1_007
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 413
نویسندگان
دانش آموخته دکتری، گروه بیوتکنولوژی کشاورزی، دانشکده علوم کشاورزی، دانشگاه گیلان، رشت، ایران
استاد، گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده علوم کشاورزی، دانشگاه گیلان، رشت، ایران
چکیده
برنج به عنوان یکی از مهم ترین گیاهان زراعی، کوچک ترین ژنوم را در بین غلات دارد و به عنوان یک گیاه مدل برای مطالعات ژنتیکی مطرح است. کوچک بودن ژنوم این گیاه باعث شده است که مطالعات جامعی روی آن انجام شود و در نتیجه مقدار زیادی اطلاعات بهدست آید. جمعآوری و نگهداری مناسب این اطلاعات (دادهها) و مدیریت هر چه بهتر داده های حاصل از آزمایشهای مختلف در قالب یک پایگاه دادهها، جهت دسترسی محققین به آنها برای جلوگیری از دوباره کاری و نیز مقایسه نتایج خود با نتایج سایر محققین، از اهمیت ویژهای برخوردار است. برای رسیدن به این هدف، می توان از بیوانفورماتیک کمک شایان توجهی گرفت. بنابراین، ایجاد و توسعه پایگاههای داده های تخصصی و استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیک برای پردازش داده ها، سازمان دهی کارآمد، تجزیه و تحلیل و تجسم آن ها امری ضروری است. در این مقاله، پایگاه های دادههای عمده برای مطالعه بیان ژنها در سه سطح RNA، پروتئین و متابولوم در گیاه برنج بررسی میشود و ویژگی های این پایگاه ها برای هر سطح مورد بحث و بررسی قرار میگیرد.کلیدواژه ها
بیوانفورماتیک, پایگاه های داده مبتنی بر وب, مسیرهای متابولیکاطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.