بررسی تنوع ژنتیکی گیاه چمن شور ساحلی (Aeluropus littoralis) با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره انتقال پذیر مبتنی بر EST
- سال انتشار: 1396
- محل انتشار: پژوهشنامه اصلاح گیاهان زراعی، دوره: 9، شماره: 22
- کد COI اختصاصی: JR_JCB-9-22_003
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 230
نویسندگان
Sari Agricultural Sciences and Natural Resources University
Sari Agricultural Sciences and Natural Resources University
Sari Agricultural Sciences and Natural Resources University
Sari Agricultural Sciences and Natural Resources University
چکیده
گیاه چمنشور ساحلی یکی از موفقترین گراسهای تکلپه مطرح از نظر تحمل به شوریهای زیاد است که ارزش علوفهای داشته و دارای خصوصیات فیزیولوژیک ارزشمندی است. هدف از این مطالعه معرفی و دسترسی سریع به نشانگرهای مولکولی مبتنی بر DNA و بررسی تنوع ژنتیکی در گونه شورزی و ارزشمند چمنشور ساحلی (Aeluropus littoralis) میباشد. بدین منظور آزمون تکثیر ژنومی در این گیاه با استفاده از ۱۱۰ جفت نشانگر ریزماهواره EST بدست آمده از گونههای گندم، برنج و جو برای شناسایی نشانگرهای انتقالپذیر انجام گرفت. بر این اساس میزان کل انتقالپذیری نشانگرهای ریزماهواره EST با منشاء غلات در گیاه چمنشور ساحلی ۴۴ درصد بدست آمد. این نتیجه نشان میدهد که از مخزن نشانگرهای ریزماهواره غلات میتوان برای دستیابی و توسعه نشانگرهای مولکولی در سایر گونههای ارزشمند خویشاوند با صرف کمترین زمان و هزینه استفاده نمود. در ادامه بهمنظور بررسی میزان کارآمدی نشانگرهای انتقالپذیر شناساییشده در ارزیابی سطح تنوع و گروهبندی ژنتیکی، از ۱۲ جفت نشانگر انتقالپذیر استفاده گردید. در مجموع ۷۴ مکان ژنی با میانگین ۱/۶ آلل به ازای هر جفت آغازگر تکثیر شدند که بیش از۹۰ درصد آنها چندشکل بودند. شاخص PIC برای نشانگرهای مورد بررسی بین ۲۶/۰ و ۳۸/۰ با میانگین ۳۳/۰ محاسبه شد. در نهایت تجزیه خوشهای، اکوتیپهای آلوروپوس را در ۷ گروه دستهبندی کرد. بر این اساس اکوتیپ ها ازلحاظ فاصله جغرافیایی نسبتا از هم تفکیک شدند و میزان چند شکلی افراد و تفاوت گروهها با مشاهدات ظاهری و تنوع کیفی بین نمونه ها مطابقت بالایی داشت.کلیدواژه ها
Aeluropus littoralis, EST-SSR, Genetic diversity, Transferability, انتقال پذیری, تنوع ژنتیکی, چمن شور ساحلی (Aeluropus littoralis), ریزماهواره ESTاطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.