تحلیل بیوانفورماتیکی نیم رخ بیان ژن در زنان دارای اختلال افسردگی اساسی

  • سال انتشار: 1400
  • محل انتشار: فصلنامه تازه های علوم شناختی، دوره: 23، شماره: 2
  • کد COI اختصاصی: JR_ICSS-23-2_007
  • زبان مقاله: فارسی
  • تعداد مشاهده: 394
دانلود فایل این مقاله

نویسندگان

فرناز اسماعیلی

MSc Student of Genetics, Department of Biology, Jahrom Branch, Islamic Azad University, Jahrom, Iran

سمانه ذوالقدری

Assistant Professor of Biophysics, Department of Biology, Jahrom Branch, Islamic Azad University, Jahrom, Iran

چکیده

مقدمه:اختلال افسردگی اساسی، یک اختلال روانی است که در زنان دو برابر مردان رخ می­دهد. در هر دو جنس، میانگین سن مبتلایان به اختلال افسردگی اساسی حدود ۲۵ سال است. مطالعات خانوادگی و دوقلویی و اپیدمیولوژیک همه به ویژگی­ های چند­عاملی و چند­ژنی صفات روان­ پزشکی اختلال افسردگی اساسی اشاره دارند. هدف از این مطالعه، غربال­گری ژن­ های مرتبط با بیماری­ زایی اختلال افسردگی اساسی توسط بیوانفورماتیک بود. روش کار: با استفاده از داده های ریزآرایه GSE۹۸۷۹۳ از پایگاه داده GEO، ۲۲۳ ژن متفاوت بیان شده (DEGs) از مقایسه نمونه ­های زن بیمار با کنترل توسط نرم­ افزار TAC به دست آمد. ژن­ های Hub از طریق STRING و Cytoscape و سپس روش غنی­ سازی KEGG غربال­گری شدند. یافته ­ها: در مقایسه نمونه­ های زن بیمار با گروه کنترل ۱۰۳ ژن افزایش بیان و۱۲۰ ژن کاهش بیان نشان دادند. نتایج تجزیه و تحلیل غنی­ سازی مسیر KEGG و panther از مقایسه نمونه­ های زن بیمار با گروه کنترل نشان داد که DEG­ها عمدتا در مسیر سیگنال­ رسانی HIF-۱، مسیر سیگنال­ رسانی FOXO، مسیر تمایز سلول­ های Th-۱۷، مسیر سیگنال­ رسانی PI۳K-Akt، مسیر مرگ برنامه­ ریزی شده­ سلول (فروپتوزیز) و مسیر سنتز پورین­ ها مهم بودند. نتایج این مطالعه نشان داد که ژن­ های IGF۱R و ATM با افزایش بیان و ژن GMPS با کاهش بیان برای زنان این بیماری نیز می­ تواند گزینه­ مناسبی جهت اهداف درمانی باشند. نتیجه­ گیری: ژن­ های کلیدی که با تجزیه و تحلیل داده­ های ریزآرایه در مطالعه حاضر به دست آمد، سرنخ­ های مهمی برای آشکار کردن­ ساز و کار مولکولی و درمان هدفمند بالینی افسردگی در زنان فراهم می­کند.

کلیدواژه ها

Major depressive disorder, Bioinformatics, Key genes, Gene expression, Microarray, اختلال افسردگی اساسی, بیوانفورماتیک, ژن­ های کلیدی, بیان ژن, ریزآرایه

اطلاعات بیشتر در مورد COI

COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.

کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.