بررسی بیوانفورماتیکی ژن کد کننده ی پپتید شبه آنتی تومور- ضددرد از عقرب زرد ایرانی (Mesobuthus eupeus)
- سال انتشار: 1395
- محل انتشار: مجله دانشگاه علوم پزشکی شهرکرد، دوره: 18، شماره: 3
- کد COI اختصاصی: JR_SKUMS-18-3_011
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 302
نویسندگان
Genetics Dept., Shahrekord University, Sharekord, I.R. Iran
Genetics Dept., Shahrekord University, Sharekord, I.R. Iran
Genetics Dept., Shahrekord University, Sharekord, I.R. Iran
چکیده
زمینه و هدف: در سال های اخیر مطالعات متعددی بر روی سموم حیوانات و حشرات برای یافتن مولکول هایی با خواص دارویی انجام شده است. سموم عقرب دارای مولکول های کوچکی با خواص زیستی و دارویی مختلف می باشند. یکی از این توکسین ها پپتید آنتی تومور- ضددرد (AGAP) است که در درمان سرطان و تسکین درد موثر می باشد. در این مطالعه تحقیقی به تعیین توالی و بررسی های بیوانفورماتیکی ژن کدکننده ی پپتید شبه AGAP از عقرب زرد ایرانی پرداخته شد. روش بررسی: در این مطالعه تجربی، نمونه های عقرب زرد ایرانی Mesobuthus eupeus جمع آوری و پس از استخراج DNA با پرایمرهای اختصاصی نواحی حفاظت شده، تکثیر ژن کدکننده ی پپتید سمی مشابه AGAP انجام شد و(MeI AGAP) Mesobuthus eupeus Iranian AGAP نام گرفت. سپس توالی ژن شبه AGAP جهت بررسی های قرابتی با کمک نرم افزار CLC main workbench ۵ با توالی های سموم مشابه از گونه های دیگر عقرب مقایسه شد؛ همچنین توالی اینترون، عناصر تنظیمی، جایگاه های پیرایش و موقعیت آدنین نقطه ی شاخه ساز این توکسین با توالی های مشابه مورد بررسی قرار گرفت. یافته ها: توالی ژنی MeI AGAP درحدود ۵۰۷ نوکلئوتید دارد. توالی ژنی این توکسین کوتاه تر از توالی ژنی توکسین BmK AGAP به دست آمده از عقرب Buthus martensii می باشد که علت آن حذف بزرگی در توالی اینترونی آن است. توالی کدکننده ی پپتید بالغ در این توکسین تشابه ۹۳ % با توکسین BmK AGAP دارد. مطالعه ی توالی ژنی توکسین MeI AGAP از عقرب ایرانی مزوبوتوس اوپئوس تاکنون انجام نشده و گزارش توالی آن برای نخستین بار، در این مطالعه صورت گرفت. نتیجه گیری: بررسی همولوژی این توکسین با توکسین های دیگر از عقرب های مختلف، تفاوت های متعددی نشان داد که می تواند خاص گونه ی ایرانی باشد؛ همچنین تشابه زیاد با توکسین BmK AGAP، MeI AGAP را بهعنوان دارویی برای درمان سرطان و تسکین درد مطرح می کند.کلیدواژه ها
Peptide like analgesic-antitumor, Gene sequencing, Intron regulatory factors, Mesobuthus eupeus Iranian scorpion., پپتید مشابه آنتی تومور- ضددرد, توالی یابی ژنی, فاکتورهای تنظیمی اینترون, عقرب مزوبوتوس اوپئوس ایرانی.اطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.