بررسی میزان بیان ژن های خانواده CBL، در تنش خشکی و حمله ویروس در دو رقم حساس و مقاوم به خشکی گوجه فرنگی با روش PCR نیمه کمی
- سال انتشار: 1396
- محل انتشار: نشریه زیست شناسی گیاهی ایران، دوره: 9، شماره: 2
- کد COI اختصاصی: JR_IJPB-9-2_006
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 327
نویسندگان
گروه زیست شناسی، دانشگاه پیام نور، صندوق پستی ۳۶۹۷-۱۹۳۹۵ تهران، ایران
گروه بیوتکنولوژی، دانشگاه پیام نور، تهران، ایران
گروه سلولی و مولکولی، دانشکده شیمی، دانشگاه کاشان، صندوق پستی ۵۳۱۵۳-۸۷۳۱۷ کاشان، ایران
گروه زیست شناسی، دانشگاه پیام نور، صندوق پستی ۳۶۹۷-۱۹۳۹۵ تهران، ایران
گروه زیست شناسی، دانشگاه پیام نور، صندوق پستی ۳۶۹۷-۱۹۳۹۵ تهران، ایران
چکیده
کلسیم، یک جزء حیاتی مهم برای شماری از مسیر های انتقال پیام در گیاهان است که به واسطه انواعی از گیرنده های اختصاصی از جمله پروتئین های شبه کلسی نورین B (CBL) در درک تنش های محیطی، عمل می کند. در پژوهش حاضر، با رویکردهای بیوانفورماتیک، ۱۱ ژن رمزکننده پروتئین های شبه کلسی نورین B با درجه حفاظت شدگی زیاد در گیاه گوجه فرنگی شناسایی و تایید شد. با بهره گیری از یک روش مبتنی بر ارتوژنی، این پروتئین ها به ۵ کلاس مجزای SlCBL۱، SlCBL۳، SlCBL۴، SlCBL۸ و SlCBL۱۰ تقسیم بندی و نام گذاری شدند. تحلیل توالی های پروتئینی نشان داد که همه اعضای CBLهای ۱ و ۴ که شامل ۵ پروتئین می شوند، یک ناحیه حفاظت شده مریستویلاسیون در بخش N-ترمینال دارند. بررسی با روش PCR نیمه کمی نشان داد که میان CBLهای کلاس ۱، بیان ژن SlCBL۱-۳ در هردو تنش خشکی، حمله ویروس و ترکیب این دو، تنها در رقم حساس افزایش داشته است. درباره CBLهای کلاس ۳، اگرچه دو ژن SlCBL۳-۱ و SlCBL۳-۲ در تنش خشکی در هردو رقم حساس و مقاوم، افزایش بیان نشان دادند، اعمال هم زمان دو تنش، اثر افزایشی بر بیان این ژن ها نداشت. بین دو همولوگ کلاس ۴ نیز، تنها SlCBL۴-۱ در هردو تنش خشکی و ویروس افزایش بیان نشان داد. براساس نتایج، رفتار بیانی ژن های کلاسSlCBL۸ در شرایط مختلف تنش و ارقام مختلف، متنوع بود. بیان تنها ژن موجود در کلاس SlCBL۱۰ نیز در رقم حساس با هیچ کدام از تنش های یاد شده افزایش نیافت و تنها در رقم مقاوم، در تنش خشکی افزایش بیان داشت. به طورکلی، استنباط شد که با تغییر الگوی بیان ژن های CBL در هردو تنش زیستی و غیرزیستی، احتمالا مسیر های پیام رسانی CBL/CIPK متفاوتی در گیاهان حساس و مقاوم فعال می شوند.کلیدواژه ها
بیان ژن, پروتئین های شبه کلسی نورین B, تنش خشکی, حمله ویروس, کلسیم, گوجه فرنگیاطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.