استفاده از نشانگرهای اینترون-اگزون برای ارزیابی تنوع ژنتیکی در دو زیرگونه آویشن دنایی (Thymus daenensis)
- سال انتشار: 1392
- محل انتشار: مجله تاکسونومی و بیوسیستماتیک، دوره: 5، شماره: 16
- کد COI اختصاصی: JR_TBJ-5-16_004
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 344
نویسندگان
گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی، دانشگاه لرستان، خرم آباد، ایران
گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی، دانشگاه لرستان، خرم آباد، ایران
گروه زیست شناسی، دانشکده علوم پایه، دانشگاه صنعتی خاتم الانبیاء بهبهان، بهبهان، ایران
چکیده
مطالعه تنوع ژنتیکی در گیاهان دارویی از اهداف مهم اصلاحی و تکاملی است. در بررسی حاضر، تنوع ژنتیکی دو زیرگونه آویشن دنایی با استفاده از آغازگرهای نیمه تصادفی اینترون-اگزون مطالعه شد. از ۳۰ آغازگر استفاده شده، ۹۸ درصد چندشکلی از ۶۳۳ نوار تکثیر شده، ایجاد شد. بیشترین محتوای اطلاعات چندشکلی را آغازگرهای ISJ۵ و ISJ۹ و کمترین مقدار را IT۱۵-۳۲ به خود اختصاص داد. بیشترین شاخص نشانگر را آغازگر IT۱۰-۶ ایجاد کرد. تجزیه واریانس مولکولی بیانگر تنوع در خور توجه درون دو زیرگونه آویشن دنایی نسبت به تنوع بین آنها بود. دندروگرام حاصل از تجزیه خوشه ای با روش UPGMA و ضریب تشابه دایس با نرم افزار NTSYS توده ها را به چهار گروه تقسیم کرد. بیشترین دامنه تشابه ژنتیکی بین دو توده از زیرگونه آویشن دنایی مشاهده شد. دو توده مربوط به استان های فارس و سمنان نیز هر کدام یک گروه جداگانه را تشکیل دادند. نتایج گروه بندی حاصل از داده های مولکولی با گروه بندی تجزیه مختصات اصلی مطابقت داشت. همچنین، گروه بندی تجزیه خوشه ای توانست تا حدودی دو زیرگونه آویشن دنایی را از یکدیگر تفکیک نماید. نتایج حاصل از این مطالعه نشان داد که نشانگرهای اینترون-اگزون ابزار موثری در بررسی روابط خویشاوندی دو زیرگونه آویشن دنایی بوده است.کلیدواژه ها
آویشن دنایی (Thymus daenensis), تنوع ژنتیکی, چندشکلیاطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.