مطالعه پیوستگی سراسری ژنوم با صفات تولید شیر و معیار سلولهای بدنی گاوهای هلشتاین ایران
- سال انتشار: 1399
- محل انتشار: فصلنامه علوم دامی ایران، دوره: 51، شماره: 3
- کد COI اختصاصی: JR_IJAS-51-3_006
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 349
نویسندگان
دانشجوی دکتری، گروه علوم دامی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج، ایران
استاد، گروه علوم دامی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج، ایران
استاد، گروه علوم دامی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج، ایران
محقق، دانشگاه فلوریدا، آمریکا
چکیده
در پرورش گاوشیری هدف اصلی افزایش سود است. افزایش بیماری ورمپستان از مشکلات اصلی پرورش گاوشیری با کاهش طولعمر تولیدی و افزایش هزینهها، سبب تحمیل زیانهای اقتصادی جدی به این صنعت شدهاست. این مطالعه باهدف بررسی معماری ژنتیکی و شناسایی نواحی ژنومی مرتبط با صفات تولیدشیر و تعداد سلولهای بدنی بهعنوان یکی از شاخصهای ارزیابی کیفیت شیر و معیاری غیرمستقیم از بیماری ورمپستان، انجام شدهاست. برای بررسی ارتباط و شناسایی پنجرههای ژنومی اصلی، از روش مطالعه پیوستگی سراسری ژنوم یکمرحلهای با دادههای ژنومی ۱۹۳۸ راس گاو نر استفاده شد. نتایج براساس واریانس ژنتیکی افزایشی پنجرههای ۵/۱ مگابازی از SNPهای مجاور ارائه شده است. پنجرههایی که بیش از ۱% واریانس را کنترل میکنند بهعنوان نواحی ژنومی اصلی و جهت یافتن ژنهای کاندیدا استفاده شدند. تعداد ۱۱ پنجره ژنومی اصلی روی ۹ کروموزوم اتوزوم، حاوی ۹۴ ژن کاندیدا حدود ۲۰% واریانس ژنتیکی معیار سلولهای بدنی را توصیف میکردند. بیشترین واریانس مربوط به پنجرهای روی کروموزوم ۱۴ (۸۵/۳%) بود. تعداد ۶ پنجره اصلی روی ۶ کروموزوم شامل ۸۹ ژن کاندیدا، مرتبط با تولیدشیر بودند. این پنجرهها ۸/۸% واریانس و مهمترین پنجره روی کروموزوم ۱۰، حدود ۰۸/۲% واریانس را کنترل مینمودند. درخصوص مقدار چربی و پروتئین شیر، بهترتیب تعداد ۹ منطقه روی ۷ کروموزوم، حدود ۶/۱۵% و ۹ پنجره روی ۸ کروموزوم، حدود ۶/۱۰% از واریانس را توصیف میکردند. نتایج نشان داد که ۴ ناحیه ژنومی اثر پلیوتروپی دارند. یافتههای این تحقیق میتواند بهعنوان منبع اطلاعاتی مهمی در ارزیابیهای ژنومی صفات تولید شیر و تعداد سلولهای بدنی باشد.کلیدواژه ها
پنجرههای ژنومی, ژنهای کاندیدا, معیار سلولهای بدنی, هلشتایناطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.