شناسایی بیوانفورماتیکی اعضاء جدید فاکتورهای رونویسی خانواده ی ژنی WRKY در گیاه کاملینا

  • سال انتشار: 1399
  • محل انتشار: هفتمین همایش علمی پژوهشی توسعه و ترویج علوم کشاورزی و منابع طبیعی ایران
  • کد COI اختصاصی: PDCONF07_151
  • زبان مقاله: فارسی
  • تعداد مشاهده: 353
دانلود فایل این مقاله

نویسندگان

سیده مریم سیدحسن پور

دانشجوی کارشناسی ارشد مهندسی ژنتیک و بهنژادی گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید چمران اهواز

لیلا نژادصادقی

استادیار گروه مهندسی ژنتیک و بهنژادی گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید چمران اهواز

چکیده

کاملینا Camelina Sativa یک گیاه آلوهگزاپلوئید از اعضاء خانواده ی براسیکاسه میباشد که به دلیل توانایی تولید محصولات جدید، تولیدات سوختی و خوراک دام برای محققان حائز اهمیت میباشد. فاکتورهای رونویسی WRKY از بزرگترین تنظیم کننده های رونویسی در گیاهان می باشند که در مقاومت گیاه به تنشهای زیستی و غیرزیستی نقش دارند. پروتئینهای خانوادهWRKY نامشان را 60 آمینواسید بشدت محافظت شده در جایگاه WRKY domain گرفته اند. برای شناسای اعضاء جدید این خانوادهی ژنی توالیهای پروتئینی و ژنی و سایر اطلاعات مربوط به گیاه کاملینا از پایگاه های اطلاعاتی (PlantTFDB) و (Camelina genome pororal) جمع آوری شدند. توالی پروتئینی هردو پایگاه در پایگاه NCBI، blastp شدند. برای شناسایی اعضاء جدید خانواده ی ژنی WRKY در گیاه کاملینا، فاکتورهای رونویسی کاملینا با فاکتورهای رونویسی گیاه مدل آرابیدوپسیس در پایگاه NCBI نیز blastp شدند. در این بررسی 102 عضو جدید پروتئین برای گیاه کاملینا یافت شد. از 102 عضو جدید یافت شده، 8 عضو از blastp پایگاه های (Camelina genome pororal) و (PlantTFDB) و 94 عضو جدید از blastp توالی های پروتئینی کاملینا و گیاه آرابیدوپسیس حاصل شدند.

کلیدواژه ها

کاملینا، خانوادهی ژنی، دمین حفاظت شده WRKY، تنش غیرزیستی.

مقالات مرتبط جدید

اطلاعات بیشتر در مورد COI

COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.

کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.