شناسایی بیوانفورماتیکی اعضاء جدید فاکتورهای رونویسی خانواده ی ژنی WRKY در گیاه کاملینا

کاملینا Camelina Sativa یک گیاه آلوهگزاپلوئید از اعضاء خانواده ی براسیکاسه میباشد که به دلیل توانایی تولید محصولات جدید، تولیدات سوختی و خوراک دام برای محققان حائز اهمیت میباشد. فاکتورهای رونویسی WRKY از بزرگترین تنظیم کننده های رونویسی در گیاهان می باشند که در مقاومت گیاه به تنشهای زیستی و غیرزیستی نقش دارند. پروتئینهای خانوادهWRKY نامشان را 60 آمینواسید بشدت محافظت شده در جایگاه WRKY domain گرفته اند. برای شناسای اعضاء جدید این خانوادهی ژنی توالیهای پروتئینی و ژنی و سایر اطلاعات مربوط به گیاه کاملینا از پایگاه های اطلاعاتی (PlantTFDB) و (Camelina genome pororal) جمع آوری شدند. توالی پروتئینی هردو پایگاه در پایگاه NCBI، blastp شدند. برای شناسایی اعضاء جدید خانواده ی ژنی WRKY در گیاه کاملینا، فاکتورهای رونویسی کاملینا با فاکتورهای رونویسی گیاه مدل آرابیدوپسیس در پایگاه NCBI نیز blastp شدند. در این بررسی 102 عضو جدید پروتئین برای گیاه کاملینا یافت شد. از 102 عضو جدید یافت شده، 8 عضو از blastp پایگاه های (Camelina genome pororal) و (PlantTFDB) و 94 عضو جدید از blastp توالی های پروتئینی کاملینا و گیاه آرابیدوپسیس حاصل شدند.

کلیدواژه ها:

کاملینا ، خانوادهی ژنی ، دمین حفاظت شده WRKY ، تنش غیرزیستی.