روابط فیلوژنتیکی تعدادی از گونه های گندمیان بر اساس توالی ژن های گلوتنین
- سال انتشار: 1398
- محل انتشار: شانزدهمین کنگره ملی علوم زراعت و اصلاح نباتات ایران
- کد COI اختصاصی: NABATAT16_003
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 560
نویسندگان
فارغ التحصیل دکتری دانشگاه آزاد اسلامی واحد علوم و تحقیقات،
عضو هیات علمی دانشگاه آزاد اسلامی واحد علوم و تحقیقات
استاد دانشگاه تهران
چکیده
گندم مهمترین گیاه زراعی و منبع اصلی غذا برای بیش از40 درصد مردم جهان است. این گیاه دارای دامنه سازگاری زیادی بوده و در ناحیه بسیار وسیعی از دنیا کشت و کار می شود. اهمیت گندم به دلیل خصوصیات ویژه جذب آب و کشسانی خمیر آن است که ناشی از وجود پروتئین گلوتن در اندوسپرم دانه گندم است. با توجه به اینکه این پروتئین ها در سایر گونه های خویشاوند گندم هم حضور دارند، تنوع گلوتنین های دانه در گندم و هفت گونه خویشاوند نزدیک آن با استفاده از چهار پرایمراختصاصی برای گلوتنینها مورد بررسی قرار گرفتند. توالی های قطعات تکثیر شده با اطلاعات بانک اطلاعاتی NCBI مقایسه شده و توالی هایی که بیش از %90 با یک LMW-Gs و یا HMW-Gs گندم شباهت داشت برای تجزیه و تحلیل مورد استفاده قرار گرفتند. نتایج بیانگر شباهت زیاد گلوتنینها در میان گندم و سایر گونه های خویشاوند آن بود. با اینحال مشاهده گردید که در اغلب موارد قطعات مشابه، تکثیر شده در گونه های مختلف دارای تفاوتهایی با یکدیگر بوده و تنوع برای توالی نوکلوئوتیدها در میان این گونه ها وجود دارد. بررسی روابط فیلوژنتیکی میان گونه ها نشان داد که گونه T. aestivum، با گونه T. boeoticum که دارای ژنوم A است و همچنین گونه Ae. tauschii که والد ژنوم D گندم است، از نظر ساختار ژنهای کد کننده گلوتنینها دارای شباهت زیادی بوده و در خوشه های فیلوژنتیکی نزدیک به هم قرار گرفتند. دو گونه Ae. juvenalis و Ae. vavilovi اگرچه شباهت زیادی با یکدیگر نشان نمیدهند، اما هر دو دارای شباهت زیادی با گونه والدی Ae. crassa بوده و معمولا با این گونه در یک گروه قرار گرفتند. وجود تنوع وسیع برای این پروتئینها در میان خویشاوندان گندم و همچنین روابط فیلوژنتیکی نزدیک و تلاقیپذیری این گونه ها با گندم نوید بخش استفاده از این تنوع بزرگ ژنتیکی در برنامه های اصلاحی گندم است.کلیدواژه ها
فیلوژنی، گلوتنین، گندم، گونه های آژیلوپساطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.