Bioinformatics evaluation of hsa-miR-542-3p signaling pathways and its associated rs3088012 function in patients with chronic myeloid leukemia
- سال انتشار: 1399
- محل انتشار: کنگره بین المللی علوم زیست پزشکی اصفهان
- کد COI اختصاصی: ICIBS01_033
- زبان مقاله: انگلیسی
- تعداد مشاهده: 474
نویسندگان
Department of Biotechnology, Faculty of Biological Science and Technology, Shahid Ashrafi Esfahani University, Isfahan, Iran
Department of Biotechnology, Faculty of Biological Science and Technology, University of Isfahan, Isfahan, Iran
Medical Genetic Department, National institute for Genetic Engineering and Biotechnology
Gene Raz Buali, Genetic and Biotechnology Academy, Isfahan, Iran
چکیده
Introduction & Objectives: Chronic Myeloid Leukemia (CML) is a slow-growing cancer of the blood-forming tissue. In chronic myeloid leukemia the bone marrow produces too many white blood cells. CML is characterized by the presence of the Philadelphia chromosome (Ph+), which contains the oncogenic BCR-ABL1 fusion gene resulting from a translocation between chromosomes 9 and 22. ABL1 is mutated in 8.82% of CML patients.Materials & Methods: To get more information we used NCBI, miRNASNP, miRBase, miRWALK2.0, DAVID databases and KEGG pathway as the bioinformatics tools.Results: Investigations at the rs3088012 locus indicated that T allele altered to C, which may effect on function of the miRNA associated with this region. Finally, hsa-miR-542-3p as one of the most important miRNAs related to ABL1 and given the confirmation of the role of hsa-miR-542-3p in CML through bioinformatics databases, this miRNA selected for this analysis.Conclusion: The studies due to rs3088012 have shown that when the SNP locus is in the mutant C allele, the miRNA binds to it less strongly than the wild T allele. So when this SNP occurs, hsa-miR-542-3p has less inhibitory effect on it and ABl1 is transcribed more. Due to the inhibitory action of MDM2 on p53, we predicted that a person with this harmful polymorphism is more susceptible to CML by increasing the expression of the ABL1.کلیدواژه ها
Chronic Myeloid leukemia, hsa-miR-542-3p, CML, ABL1, KEGG pathwayمقالات مرتبط جدید
- تاثیر تاریخ کاشت و رقابت جمعیت های یولاف وحشی زمستانه (.(Avena ludoviciana Dur بر مراحل فنولوژی گندم
- اثر خاکدهی پای بوته بر تغییرات مکانی کاتوس(.(Cynanchum acutum L در مزارع نیشکر
- تاثیر خاکپوش کاه و کلش گندم و علف کش لینورون بر کنترل علف هرز چچم سخت (Lolium rigidum Gaudin)در رازیانه (Foeniculum vulgare Mill.)
- بررسی کارایی روشهای مختلف کنترل علف های هرز مزارع توت فرنگی استان کردستان
- استفاده از خاکپوش زنده جهت کنترل غیرشیمیایی علف های هرز و تولید روغن با کیفیت بالا در سیاهدانه (.(Nigella sativa L
اطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.