فراتحلیل (متا-آنالیز) داده های بیان ژن بافت پستان آلوده شده با باکتری اشریشیاکلی در گاوهای شیری
- سال انتشار: 1396
- محل انتشار: فصلنامه علوم دامی ایران، دوره: 48، شماره: 3
- کد COI اختصاصی: JR_IJAS-48-3_004
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 373
نویسندگان
دانشجوی دکتری، دانشکده کشاورزی دانشگاه صنعتی اصفهان، اصفهان
دانشیار، دانشکده کشاورزی، دانشگاه صنعتی اصفهان، اصفهان
دانشیار، گروه بیوتکنولوژی دانشگاه شیراز و عضو گروه تحقیقاتی دانشگاه آدلاید- استرالیا
چکیده
تشخیص ژن های درگیر در صفات پیچیده مانند حساسیت به بیماری نه تنها می تواند موجب بهبود تشخیص و پیشگیری از بیماری مورد نظر می شود، بلکه در انتخاب راه های درمانی کارآمد و همچنین در انتخاب دام های مقاوم به اصلاحگران کمک خواهد کرد. در این تحقیق با هدف بالا بردن توان تجزیه آماری در شناسایی ژن ها و مسیرهای زیستی (بیولوژیکی) درگیر در بیماری ورم پستان، از فراتحلیل به روش Fisherبرای یکی کردن p-value های به دست آمده از تجزیه انفرادی داده های شش بررسی ریزآرایه که بیان ژن بافت پستان هنگام درگیری با باکتری اشریشیاکلی (E. coli) در گاوهای شیری را بررسی کرده بودند، استفاده شد. شناسایی ژن هایی که در هیچ یک از بررسی های انفرادی معنیدار نشده بودند میتواند تاییدکننده هدف بیان شده باشد که منجر به ارائه مجموعه کامل تری از مسیرهای زیستی مرتبط با سامانه ایمنی، التهاب، تجزیه پروتئین (پروتئولیز) و مسیرهای مرتبط با رشد و افزونش و مرگ یاخته ای شد. کنترل مثبت بیان پروموتور RNA پلیمراز II مسیر جدیدی در رابطه با این بیماری است که با وجود در بر گرفتن بیشترین شمار ژن در این بررسی ، در بررسی های گذشته مرتبط با ورم پستان گزارش نشده است.کلیدواژه ها
آنتولوژی ژن, اشریشیاکلی, تفاوت بیان ژن, گاو شیری, ورم پستاناطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.