پویش ژنگان کل برای تعیین جایگاه های تحت انتخاب مثبت در گوسفندان نژاد زندی
- سال انتشار: 1396
- محل انتشار: فصلنامه علوم دامی ایران، دوره: 48، شماره: 4
- کد COI اختصاصی: JR_IJAS-48-4_006
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 523
نویسندگان
دانشجوی دکتری گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تبریز
استاد گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تبریز
استادیار گروه علوم دامی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج
گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تبریز.
چکیده
شناسایی مناطق ژنگانی (ژنوم) که هدف انتخاب بودهاند، یکی از راهکار های اصلی تحقیقات زیستی است. هدف این پژوهش، پویش کل ژنگان برای شناسایی مناطقی از ژنگان گوسفندان نژاد زندی که در طی سالهای مختلف هدف انتخابهای طبیعی یا مصنوعی قرار گرفته اند، بود. بدین منظور 96 راس گوسفند نژاد زندی با استفاده از آرایههای ژنگانی Illumina ovine SNP50K BeadChip تعیین ژنوتیپ شدند. برای شناسایی نشانههای انتخاب بر پایه روشهای نداشتن تعادل پیوستگی (لینکاژی) از آزمون (iHS)integrated haplotype score استفاده شد. نتایج یازده منطقه ژنگانی روی کروموزومهای 1 (2 منطقه)، 3، 6، 7، 8، 9، 10، 17، 22 و 26 را شناسایی کرد. تجزیه وتحلیل داده های زیستی (بیوانفورماتیکی) نشان داد، برخی از این مناطق ژنگانی به طور مستقیم و غیرمستقیم با ژنهای موثر بر سازگاری (آداپتاسیون) به آب وهوای گرم و خشک (DNAJB4، HSPA4L، MSRB3)، پاسخ ایمنی (IL23A، STAT6، LY96)، توسعه و اندازه بدن (STAC3، LAP3)، توسعه نظام ساختار بدنی یا اسکلتی (SPP1، MEPE، IBSP) و سوخت وساز (متابولیسم) انرژی (ATP5B، GLS2، CS) همپوشانی دارند. درنهایت بررسیQTLهای گزارش شده در ژنگان گوسفند نشان داد، این مناطق با QTLهای صفات مهم اقتصادی از جمله صفات مرتبط با رشد، لاشه و پشم در ارتباط است. به هرحال، برای شناسایی دقیق این ژنها و QTLها لازم است بررسی های پیوستگی و عملکردی بیشتری انجام شود.کلیدواژه ها
آزمونiHS, پویش ژنگانی, سازگاری, شناسایی نشانه های انتخاباطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.