ورود
مقالات فارسیISIکنفرانسهاژورنالها

مطالعه فیلوژنی و بیان ژن های پلی آمین اکسیداز (PAO) در ذرت (Zeamays L.)

محل انتشار: فصلنامه تحقیقات غلات، دوره: 8، شماره: 1
سال انتشار: 1397
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 204

فایل این مقاله در 12 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

این مقاله در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:
https://civilica.com/doc/1296281

شناسه ملی سند علمی:

JR_CRGU-8-1_007

تاریخ نمایه سازی: 3 آبان 1400

چکیده مقاله:

پلی­آمین­ها به­وسیله آنزیم های آمین­ اکسیداز شامل آمینواکسیدازهای حاوی مس (CuPAO) و پلی­آمین اکسیدازهای (PAO) وابسته به FAD به­صورت اکسیداتیو دآمینه می­شوند. شواهد زیادی مبنی بر نقش ضروری پلی­آمین­ اکسیدازها در رشد و نمو گیاهان مانند اندام­زایی و پیری و نیز پاسخ به تنش­های زیستی و غیرزیستی وجود دارد. در دسترس قرار گرفتن توالی ژنوم ذرت فرصت بسیار مناسبی برای مستندسازی، گروه بندی و نیز مطالعات ژنومیکس مقایسه­ای مهیا ساخته است. در این مطالعه از طریق آنالیزهای بیوانفورماتیک، ZmPAO۱تاZmPAO۹ در ژنوم ذرت شناسایی شد. آنالیز فیلوژنتیک نشان داد که ژن های ZmPAO همانند اورتولوگ آن ها در آرابیدوپسیس و برنج به سه گروه اصلی تقسیم می­شوند. ضمن اینکه ژن­های PAO ذرت ارتباط تکاملی نزدیک­تری با ژن­های برنج در مقایسه با آرابیدوپسیس دارند. مطالعه ساختار ژنی نشان داد که تعداد اینترون های ZmPAO از صفر تا نه متغیر است و روی چهار کروموزوم از ده کروموزوم ذرت قرارگرفتهاست. مضاعف شدگی تاندوم و سگمنتال موجب افزایش تعداد اعضای خانواده ژنی PAO در ذرت شده­اند. با استفاده از داده­های ریزآرایه در دسترس، پروفایل رونوشت برداریژن­هایZmPAO در فرآیندهای رشد و نمو ذرت ارزیابی و نتایج نشان­دهنده نقش احتمالی آن­ها در تنظیم نمو بود. نتایج این مطالعه اطلاعات پایه ای را ارایه کرد که برای مطالعات عملکردی آینده در مورد فعالیت ژن­های ZmPAO در بافت­ها، نقش آن ها در نمو و نیز در پاسخ به تنش­ها مفید و موثر است.

کلیدواژه ها:

نویسندگان

امین عابدی

دانش آموخته دکتری، گروه بیوتکنولوژی کشاورزی،دانشکده علوم کشاورزی، دانشگاه گیلان، رشت، ایران

محمد مهدی سوهانی

دانشیار، گروه بیوتکنولوژی کشاورزی، دانشکده علوم کشاورزی، دانشگاه گیلان، رشت، ایران

رضا شیرزادیان

استادیار، گروه بیوتکنولوژی کشاورزی، دانشکده علوم کشاورزی، دانشگاه گیلان، رشت، ایران

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Alcázar, R., Altabella, T., Marco, F., Bortolotti, C., Reymond, M., ...
  • Angelini, R., Cona, A., Federico, R., Fincato, P., Tavladoraki, P. ...
  • Artimo, P., Jonnalagedda, M., Arnold, K., Baratin, D., Csardi, G., ...
  • Bateman, A., Coin, L., Durbin, R., Finn, R. D., Hollich, ...
  • Cao, J. and Shi, F. ۲۰۱۲. Evolution of the RALF ...
  • Chen, B.-X., Li, W.-Y., Gao, Y.-T., Chen, Z.-J., Zhang, W.-N., ...
  • Cheng, X.-Q., Zhu, X.-F., Tian, W.-G., Cheng, W.-H., Sun, J., ...
  • Cona, A., Rea, G., Angelini, R., Federico, R. and Tavladoraki, ...
  • Dash, S., Van Hemert, J., Hong, L., Wise, R. P. ...
  • Duarte, J. M., Cui, L., Wall, P. K., Zhang, Q., ...
  • Fincato, P., Moschou, P. N., Ahou, A., Angelini, R., Roubelakis-Angelakis, ...
  • Finn, R. D., Bateman, A., Clements, J., Coggill, P., Eberhardt, ...
  • Finn, R. D., Clements, J. and Eddy, S. R. ۲۰۱۱. ...
  • Fu, X.-Z., Chen, C.-W., Wang, Y., Liu, J.-H. and Moriguchi, ...
  • Ghuge, S. A., Tisi, A., Carucci, A., Rodrigues-Pousada, R. A., ...
  • Goodstein, D. M., Shu, S., Howson, R., Neupane, R., Hayes, ...
  • Groppa, M. and Benavides, M. ۲۰۰۸. Polyamines and abiotic stress: ...
  • Gu, T., Han, Y., Huang, R., McAvoy, R. J. and ...
  • Hanada, K., Zou, C., Lehti-Shiu, M. D., Shinozaki, K. and ...
  • Hu, B., Jin, J., Guo, A.-Y., Zhang, H., Luo, J. ...
  • Hu, L. and Liu, S. ۲۰۱۲. Genome-wide analysis of the ...
  • Huang, W., Xian, Z., Kang, X., Tang, N. and Li, ...
  • Hundertmark, M. and Hincha, D. K. ۲۰۰۸. LEA (late embryogenesis ...
  • Jiang, S.-Y., Ma, Z. and Ramachandran, S. ۲۰۱۰. Evolutionary history ...
  • Kumar, S., Stecher, G. and Tamura, K. ۲۰۱۶. MEGA۷: Molecular ...
  • Larkin, M. A., Blackshields, G., Brown, N., Chenna, R., McGettigan, ...
  • Lee, T.-H., Tang, H., Wang, X. and Paterson, A. H. ...
  • Liu, J.-H., Wang, W., Wu, H., Gong, X. and Moriguchi, ...
  • Liu, T., Wook Kim, D., Niitsu, M., Berberich, T. and ...
  • Masson, P. H., Takahashi, T. and Angelini, R. ۲۰۱۷. Editorial: ...
  • Moschou, P. N., Paschalidis, K. A. and Roubelakis-Angelakis, K. A. ...
  • Rodriguez, A. A., Maiale, S. J., Menéndez, A. B. and ...
  • Sekhon, R. S., Lin, H., Childs, K. L., Hansey, C. ...
  • Sharp, P. A. ۱۹۸۱. Speculations on RNA splicing. Cell ۲۳(۳): ...
  • Shibaya, T., Hori, K., Ogiso-Tanaka, E., Yamanouchi, U., Shu, K., ...
  • Sonnhammer, E. L. and Koonin, E. V. ۲۰۰۲. Orthology, paralogy ...
  • Swigonova, Z., Lai, J., Ma, J., Ramakrishna, W., Llaca, V., ...
  • Takahashi, Y., Cong, R., Sagor, G., Niitsu, M., Berberich, T. ...
  • Wang, Q., Liu, J., Wang, Y., Zhao, Y., Jiang, H. ...
  • Wang, W. and Liu, J.-H. ۲۰۱۵. Genome-wide identification and expression ...
  • Wu, J., Shang, Z., Wu, J., Jiang, X., Moschou, P. ...
  • Zhou, W., Wu, J., Zheng, Q., Jiang, Y., Zhang, M. ...
    • نمایش کامل مراجع