مجله «هستی و شناخت» ادامه مجله «نامه فلسفی» و مجلات نامه مفید میباشد که از سال ۱۳۷۴ تاکنون توسط دانشگاه مفید به طور پیوسته انتشار یافته است. از ابتدای سال ۱۳۷۴ مجله نامه مفید، به عنوان اولین و تنها مجله علمی - پژوهشی منتشره در شهر مقدس قم، به مدت یازده سال در حوزه‌های مختلف علوم انسانی خصوصا حوزه‌های اقتصادی، فلسفی، حقوقی، علوم قرآنی و سیاسی به انتشار مقالات دانشگاهی پرداخت. به دنبال رشد کیفی جامعه علمی کشور و تخصصی تر شدن مجلات دانشگاهی به تناسب، نامه مفید نیز فعالیت خود را تنها به سه رشته محدود ساخت و از سال ۱۳۸۴ تحت سه عنوان تخصصی «نامه فلسفی»، «نامه اقتصادی» و «نامه حقوقی» به صورت دو شماره در سال انتشار یافت.
بر اساس سیاست جدید وزارت علوم، تحقیقات و فناوری و تخصصیتر شدن مجلات دانشگاهی تصویب شد هر مجله نه تنها در یک موضوع فعالیت نماید، بلکه در آن رشته نیز دامنه فعالیت خود را به زمینه‌های خاصی محدود سازد. به علاوه بر اساس سیاست‌های پیش‌گفته از مجلات دانشگاهی درخواست شد نام خود را نیز به تناسب تغییر دهند. در پیروی از این سیاست‌ها، از ابتدای سال ۱۳۸۹ مجلات نامه مفید، به جای سه عنوان نامبرده با عنوان‌های تخصصیتر «هستی و شناخت»، «سیاست‌های اقتصادی» و «حقوق تطبیقی» انتشار مییابد. بنابراین «هستی و شناخت» در واقع نام جدید مجله‌ای است که پیش از این «نامه فلسفی» شناخته شده است.