مجله «هستی و شناخت» ادامه مجله «نامه فلسفی» و مجلات نامه مفید می باشد که از سال ۱۳۷۴ تاکنون توسط دانشگاه مفید به طور پیوسته انتشار یافته است. از ابتدای سال ۱۳۷۴ مجله نامه مفید، به عنوان اولین و تنها مجله علمی - پژوهشی منتشره در شهر مقدس قم، به مدت یازده سال در حوزه های مختلف علوم انسانی خصوصا حوزه های اقتصادی، فلسفی، حقوقی، علوم قرآنی و سیاسی به انتشار مقالات دانشگاهی پرداخت. به دنبال رشد کیفی جامعه علمی کشور و تخصصی تر شدن مجلات دانشگاهی به تناسب، نامه مفید نیز فعالیت خود را تنها به سه رشته محدود ساخت و از سال ۱۳۸۴ تحت سه عنوان تخصصی «نامه فلسفی»، «نامه اقتصادی» و «نامه حقوقی» به صورت دو شماره در سال انتشار یافت.
بر اساس سیاست جدید وزارت علوم، تحقیقات و فناوری و تخصصی تر شدن مجلات دانشگاهی تصویب شد هر مجله نه تنها در یک موضوع فعالیت نماید، بلکه در آن رشته نیز دامنه فعالیت خود را به زمینه های خاصی محدود سازد. به علاوه بر اساس سیاست های پیش گفته از مجلات دانشگاهی درخواست شد نام خود را نیز به تناسب تغییر دهند. در پیروی از این سیاست ها، از ابتدای سال ۱۳۸۹ مجلات نامه مفید، به جای سه عنوان نامبرده با عنوان های تخصصی تر «هستی و شناخت»، «سیاست های اقتصادی» و «حقوق تطبیقی» انتشار می یابد. بنابراین «هستی و شناخت» در واقع نام جدید مجله ای است که پیش از این «نامه فلسفی» شناخته شده است.