آنالیز ناحیه پروموتری ژن مربوط به آنزیم beta-amyrin synthaseدر گیاهEutrema salsugineum
- سال انتشار: 1397
- محل انتشار: سومین کنگره بین المللی و پانزدهمین کنگره ملی ژنتیک ایران
- کد COI اختصاصی: CIGS15_535
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 1000
نویسندگان
دانشجوی کارشناسی ارشد بیوتکنولوژی کشاورزی، دانشگاه تبریز، ایران.
فارغ التحصیل کارشناسی ارشد بیوتکنولوژی کشاورزی، پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی شمالغرب و غرب کشور، تبریز، ایران .
بخش تحقیقات اصلاح و تهیه نهال و بذر، مرکز تحقیقات و آموزش کشاورزی و منابع طبیعی استان همدان، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، همدان، ایران .
چکیده
گروهی از آنزیم های مهم کاتالیز کننده در مسیر بیوسنتز ساپونین تری ترپنوییدها، اکسیدو اسکوالن سیکلازها می باشند که آنزیم بتا آمیرین سنتاز از جمله این آنزیم ها است. در مطالعه حاضر توالی ژنومی مربوط به آنزیم beta-amyrin synthase با استفاده از بانک اطلاعاتی Phytozome در مورد گیاه Eutrema salsugineum یافت شد. آنالیز ناحیه پروموتری در 1500 جفت باز بالادست ژن مورد نظر در این گیاه نشان داد که تعداد متنوعی عناصر تنظیمی با نقش های متفاوت در پروموتر این ژن وجود دارند که نشان دهنده نقش آنها در مسیرهای مختلف فیزیولوژیک در گیاه می باشد. عمده ترین عنصر تنظیمی در این گیاه TATA-box است که به تعداد 55 عدد می باشد که به عنوان core promoter فعال می باشد. بعد از آن موتیف CAAT-box می باشد که به تعداد 27 عدد بوده و به عنوان عناصر تنظیم کننده تقویت کنندگی و افزایش دهندگی ژنی می باشد و در نوبت بعد موتیف Skn-1_motif می باشد که به تعداد 4 عدد بوده و عناصر تنظیمی فعال کننده سیس مورد نیاز برای بیان آندوسپرم می باشند. با توجه به نتایج، آنالیز ناحیه پروموتری این ژن بیانگر این است که اکثر موتیف های شناسایی شده در این گیاه به عنوان عناصر پاسخ دهنده به واکنش های نوری عمل می کنند. بنابراین واضح است، عمده فاکتورهای رونویسی که به این موتیف ها اتصال می یابند، درگیر در واکنش های نوری و فتوسنتزی خواهند بود. جداسازی پروموتر این ژن و استفاده از آن در تولید گیاهان تراریخت مقاوم به تنش های زیستی و غیر زیستی می تواند مورد استفاده قرار گیرد.کلیدواژه ها
آنالیز پروموتر، بیوانفورماتیک، β-آمیرین سینتاز، Eutrema salsugineumمقالات مرتبط جدید
اطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.