مقایسه زبان های برنامه نویسی در محاسبات زیستی
- سال انتشار: 1398
- محل انتشار: همایش ملی صنعت و تجاری سازی کشاورزی
- کد COI اختصاصی: NCICA01_080
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 730
نویسندگان
دانشجو کامپیوتر دانشکده مهندسی دانشگاه شهید چمران اهواز
عضو هیئت علمی گروه کامپیوتر دانشکده مهندسی دانشگاه شهید چمران اهواز
چکیده
مطالعه پدیده های زیستی به ویژه زیست شناسی مولکولی و ژنومیکس، تعداد توالی های DNA و پروتئین با پیشرفت های زیادی مواجه شده است. سازماندهی، تفسیر، تجزیه و تحلیل داده ها و فهم عملکرد ژن باعث ظهور شاخه ای از علم به نام بیوانفورماتیک شده است. بیوانفورماتیک اهمیت فراوانی در پیشرفت علوم مختلف از جمله زیست شناسی، بیوشیمی، کشاورزی و پزشکی داشته است. بی شک رشد و توسعه بیوانفورماتیک مرهون پیشرفت های علم رایانه علی الخصوص برنامه نویسی است. عملکرد زبان های مختلف برنامه نویسی قبلا با استفاده از الگوریتم های انتزاعی ریاضی محک زده شده ، اما از الگوریتم های استاندارد بیوانفورماتیک استفاده نشده است. هدف از این مطالعه، مقایسه زبان های مختلف برنامه نویسی از جنبه میزان علاقه مندی برنامه و از جنبه عملکرد در مدریت حافظه و سرعت اجرای برخی از الگوریتم های مورد استفاده در بیوانفورماتیک و محاسبات زیستی است. بررسی الگوریتم های ساخت درخت(اتصال همسایه ها)، همردیف سازی توالی ها و بلاست کردن به کمک زبان های Perl ،Java ،C # ،C ++ ، C و Python بیشتر مورد توجه قرار گرفت. C وC++و سپس جاوا عملکرد خوبی در سرعت اجرای الگوریتم های زیست محاسبات و مدیریت حافظه دارند، اگرچه پرل و پایتون احتمالا به خاطر داشتن کتابخانه های تخصصی تر در زمینه های ژنتیک کشاورزی و پزشکی مورد توجه بیشتر برنامه نویسان قرار گرفته اند.کلیدواژه ها
بیوانفورماتیک، برنامه نویسی، زیست محاسبات، کشاورزیمقالات مرتبط جدید
اطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.