مقایسه تکرار های شناسایی شده در شترهای دو کوهانه با دیگر گونه ها

  • سال انتشار: 1398
  • محل انتشار: اولین کنفرانس بین المللی و چهارمین کنفرانس ملی صیانت از منابع طبیعی و محیط زیست
  • کد COI اختصاصی: CNRE04_070
  • زبان مقاله: فارسی
  • تعداد مشاهده: 554
دانلود فایل این مقاله

نویسندگان

ناهیده زارع ایوریق

گروه علوم دامی دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه محقق اردبیلی

نعمت هدایت

گروه علوم دامی دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه محقق اردبیلی

رضا سید شریفی

گروه علوم دامی دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه محقق اردبیلی

رضا خلخالی

گروه علوم دامی دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه محقق اردبیلی

آزاده بوستان

گروه علوم دامی دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه محقق اردبیلی

چکیده

عناصر متحرک (TE ها) توالی های تکراری DNA هستند که در ژنوم پیدا می شوند در سراسر درخت زندگی پراکنده اند و اغلب به خاطر توانایی آنها در تکرار و حرکت به مکان های جدید ژنومی به عنوان ژن های پرشی نامیده می شوند. همچنین آنها منبع مهمی از تنوع ژنومی در هر دو سطح گونه و فردی فراهم می کند. این مطالعه با هدف شناسایی عناصر متحرک در ژنوم شترهای دوکوهانه جهت استفاده در تنوع زیستی بالقوه انجام گرفت. جهت انجام آن توالی کامل ژنوم شتر دوکوهانه با استفاده از روش توالی یابی نسل جدید تهیه و سرهم سازی شد سپس از طریق برنامه Repeat Masker v4.0.7 با ترکیب دو پایگاه اطلاعاتی Repbase و Dfam برای جستجوی عناصر متحرک شناسایی شده در ژنوم ها مورد استفاده قرار گرفت. بر اساس نتایج به دست آمده محتوای توالی های تکراری به دست آماده شتر های دوکوهانه 30/02 درصد که اندکی کمتر از شتر تک کوهانه آفریقایی با 33/72% و شتر دو کوهانه با 33/68% بود که خانواده LINE با 17.79 درصد توالی های تکراری بزرگترین گروه توالی های تکراری در شترهای دوکوهانه هستند. همچنین این مقدار کمتر از شتر تک کوهانه آفریقایی (19/8%) و شتر دوکوهانه (19/32%) بود. در این خانواده LINE1 با 13/20% و RTE با 0/17 % به ترتیب بیشترین و کمترین سهم را به خود اختصاص داده اند.

کلیدواژه ها

شتر های دوکوهانه، عناصر متحرک، سرهم سازی، تنوع زیستی.

مقالات مرتبط جدید

اطلاعات بیشتر در مورد COI

COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.

کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.