Study of spermine as an inhibitor of carbonic anhydrase by anchoring to the zinc-coordinated water molecule.
- سال انتشار: 1398
- محل انتشار: بیست و یکمین سمینار شیمی معدنی انجمن شیمی ایران
- کد COI اختصاصی: IICC21_228
- زبان مقاله: انگلیسی
- تعداد مشاهده: 420
نویسندگان
Department of Chemistry, Faculty of Physics & Chemistry, Alzahra University, ۱۹۸۳۵-۳۸۹, Vanak, Tehran, Iran.
Department of Chemistry, Faculty of Physics & Chemistry, Alzahra University, ۱۹۸۳۵-۳۸۹, Vanak, Tehran, Iran.
چکیده
Carbonic anhydrases(CAs) have been inhibited by different compounds such as phenols and coumarins. Usually, polyamines, have been used as activators of carbonic anhydrases enzymes, but they have been investigated recently as new inhibitors of human carbonic anhydrase. Spermine is a derivative of polyamines, which is a small aliphatic molecule found in fungi,archaea andplants[1, 2].In the present research we used the B3lyp method with the standard 6-31+g* basic set to predict the optimized geometries and interaction energies between inhibitors and CA active site.According to our calculated results poly aminescan be used as a suitable inhibitor, which has at least 7 atoms in the chain, with one free NH2group.Also the results show optimized spermine with threonine (Thr) amino acid have been established by different hydrogen bondings. Thus, an important point of this work is that we observed for the first time the anchoring of a primary amine (as charged ammonium moiety) to the zinc-bound solvent molecule of CA, through a network of hydrogen bonds involving also the conserved amino acidresidue Thr199.Finally, the good agreement between predicted results with X-ray crystallographic data confirm the reliability of selected methods for these kind of molecules.کلیدواژه ها
مقالات مرتبط جدید
- سنتز نانو ماده اکسیدگرافن و بررسی تاثیر آن بر روی مقاومت شیمیایی رنگ آلکیدی
- پیش بینی نرخ های تولید چندفازی (نفت، گاز و آب) با استفاده از روش های یادگیری ماشین: مرور بر روش ها و کاربردها
- روشهای کنترل داده محور در مهندسی شیمی
- بررسی جداسازی گاز پروپیلن از پروپان در غشای ۶FDA-durene با استفاده از روش شبیه سازی مولکولی
اطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.