نرم افزار رایانه ای تحت وب تشخیص گونه های قارچی (FUNGID)، مطالعه موردی: جنس Phaeoacremonium

  • سال انتشار: 1398
  • محل انتشار: نخستین کنگره بیماری شناسی گیاهی ایران
  • کد COI اختصاصی: PPC01_118
  • زبان مقاله: فارسی
  • تعداد مشاهده: 449
دانلود فایل این مقاله

نویسندگان

محدثه فرشباف بدر

گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید مدنی آذربایجان

سمانه نوریان بارانلو

گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید مدنی آذربایجان

علیرضا علیزاده

گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید مدنی آذربایجان

علی چناری بوکت

بخش تحقیقات گیاهپزشکی، مرکز تحقیقات و آموزش کشاورزی و منابع طبیعی استان آذربایجان شرقی، سازمان تحقیقات،آموزش و ترویج کشاورزی، تبریز، ایران

چکیده

به منظور تسهیل در شناسایی گونه های قارچها یک نرم افزار بر پایه وب طراحی گردید. بخش اول این برنامه برای تشخیص گونه های جنس Pythium طراحی گردیده بود و اکنون بخش دوم آن برای تعدادی از گونه های جنس Phaeoacremonium آماده شده است. این برنامه به راحتی در رایانه های شخصی با حداقل امکانات سخت افزاری و نرم افزاری قابل راه اندازی است. این برنامه میتواند توسط کاربر ویرایش گردد و با وارد ساختن صفات ریخت شناختی و داده های ریخت سنجی گونه ناشناخته در بخش جستجو (search)، تعدادی از گونه های ثبت شده در پایگاه داده به عنوان گونه های احتمالی به کاربر پیشنهاد و وی بر اساس توصیف گونه های پیشنهادی و سایر اطلاعات ضمیمه به انتخاب یکی از گونه ها راهنمایی میشود. این برنامه در زبان برنامه نویسی تحت وب ASP.NET توسعه یافته است. پایگاه داده باSQL.SERVER پشتیبانی میشود و به راحتی و به صورت رایگان در دسترس است. در این نرم افزار برای هریک از گونه های جنسPhaeoacremonium صفات ریخت شناسی و داده های ریخت سنجی شامل رنگ کلنی در محیط MEA، ساختار کنیدیوفور، حداقل و حداکثر طول کنیدیوفور، نوع فیالید، توالیDNAکه قبلا در GenBank برای گونه های جنس Phaeoacremonium ثبت گردیده، مشخص شده اند. این برنامه قابل گسترش به سایر ارگانیسم ها مانند کنه ها، حشرات، نماتدهای انگل و غیر انگل گیاهی، باکتریها و سایر قارچها و شبه قارچها نیز است. به حالت آسان برای استفاده (user friendly) طراحی شده، از طریق وبگاهwww.fungid.ir قابل دستیابی بوده و اولین برنامه تحت وب تشخیص ریخت شناختی گونه های قارچی با تاکید بر گونه های جنس Phaeoacremonium است که در ایران پردازش و معرفی گردیده است.

کلیدواژه ها

مقالات مرتبط جدید

اطلاعات بیشتر در مورد COI

COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.

کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.