شناسایی miRNA های دخیل در مسیر گل دهی گیاه چغندرقند (.Beta vulgaris L)

سال انتشار: 1397
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 377

فایل این مقاله در 17 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_JRSB-34-2_002

تاریخ نمایه سازی: 22 مهر 1398

چکیده مقاله:

یکی از فرآیندهای کنترلی در بسیاری از گیاهان از جمله چغندرقند انتقال از مرحله رشد رویشی به زایشی می­باشد که توسط شبکه پیچیده­ای از پروتئین­ها تنظیم می­شود. تاکنون چندین مسیر تنظیمی دخیل در مسیر گل­دهی و بولتینگ و ژن­های موثر در آن­ها در گیاه مدل آرابیدوپسیس شناسایی شده است. یک مسیر موثر در انتقال از مرحله رویشی به زایشی مسیر وابسته به سن است که تحت­تاثیر دو miRNA172 و miRNA156 می باشد. ژن­های کدکننده miRNA ها در بین گیاهان بسیار گسترده و حفاظت­شده هستند. در این تحقیق، برای شناسایی توالی این دو ژن در ژنوم چغندرقند، توالی آن­ها از چندین گیاه جمع­آوری و با توالی­های Refseq-genomic چغندرقند مورد هم­ردیفی قرار گرفتند. نواحی با توالی مشترک شناسایی و اطلاعات آن­ها به طور دقیق مورد بررسی قرارگرفت. نتایج نشان داد که در ژنوم چغندرقند برای ژن کدکننده miR156 فقط 127 جفت باز از کروموزوم شماره 2 و ژن کدکننده miR172 فقط 110 جفت ­باز از کروموزوم شماره 9 دارای توالی­های کامل پیش­ساز miRNA بودند. جداسازی ژن کدکننده miR156 از ژنوم گیاه چغندرقند، با طراحی آغازگرهای اختصاصی از نواحی ابتدا و انتهای ژن انجام گرفت. ژن کدکننده miR156 توسط تکنیک واکنش زنجیره­ای پلیمراز و با استفاده از آغازگرهای اختصاصی MIRF و MIRR از روی DNA ژنومی چغندرقند تکثیر شد. همانگونه که انتظار می­رفت قطعه DNA 127 جفت باز تکثیر شد و در نهایت از طریق توالی­یابی مشابهت 99 درصدی توالی تکثیر شده با توالی شناسایی شده ژن کدکننده miR156 به دست آمد و صحت توالی شناسایی شده به عنوان ژن کدکننده miR156 در چغندرقند تایید گشت. شناسایی و  مطالعه این ژن­های موثر در فرآیند گل­دهی راه را برای قابلیت بررسی عملکرد دقیق آن­ها در فرآیندهای گل­دهی و بولتینگ چغندرقند خواهد گشود.

نویسندگان

میشانه عسگری

دکتری بیوتکنولوژی کشاورزی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه بوعلی سینا. همدان، ایران.

اصغر میرزائی اصل

دانشیار گروه بیوتکنولوژی کشاورزی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه بوعلی سینا. همدان، ایران.

محمدرضا عبدالهی

دانشیار گروه اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی، دانشگاه بوعلی سینا. همدان، ایران.

لیلا خدایی

استادیار گروه کشاورزی، دانشگاه پیام نور همدان. همدان، ایران.

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Ambros V. The functions of animal microRNAs. Nature 2004; 431(7006): ...
  • Aukerman MJ, Sakai H. Regulation of flowering time and floral ...
  • Bartel DP. MicroRNAs: genomics, biogenesis, mechanism, and function. Cell 2004; ...
  • Bäurle I, Dean C. The timing of developmental transitions in ...
  • Biancardi E, Campbell LG, Skaracis GN, De Biaggi M. Genetics ...
  • Blázquez M, Koornneef M, Putterill J. Flowering on time: Genes ...
  • Chia TYP, Müller A, Jung C, Mutasa-Göttgens ES. Sugar beet ...
  • Deng W, Ying H, Helliwell CA, Taylor JM, Peacock WJ, ...
  • Dohm JC, Lange C, Holtgräwe D, Sörensen TR, Borchardt D, ...
  • Han J, Kong ML, Xie H, Sun QP, Nan ZJ, ...
  • Hébrard C, Peterson DG, Willems G, Delaunay A, Jesson B, ...
  • Jahanbakhsh-Pour MH, Paknejad F, Habibi D, Aghaeezadeh M, Shahsavan-Baghdadi M. ...
  • Jung J-H, Seo Y-H, Seo PJ, Reyes JL, Yun J, ...
  • Kim JJ, Lee JH, Kim W, Jung HS, Huijser P, ...
  • Kim SY, Park BS, Kwon SJ, Kim J, Lim MH, ...
  • Kobayashi Y, Weigel D. Move on up, it’s time for ...
  • Krol J, Sobczak K, Wilczynska U, Drath M, Jasinska A, ...
  • Lau NC, Lim LP, Weinstein EG, Bartel DP. An abundant ...
  • Li Y, Li W, Jin Y-X. Computational identification of novel ...
  • Matthias PO, Ulrike B, Sarah D, Rene HP, Marcus L, ...
  • Michaels SD. Flowering time regulation produces much fruit. Current Opinion ...
  • Mirzaie-Asl A, Asgari M, Alimirzaie M. Evaluation of Flowering Pathways ...
  • Mlotshwa S, Yang Z, Kim Y, Chen X. Floral patterning ...
  • Murray HG, Thompson WF. Rapid isolation of high molecular weight ...
  • Navarro C, Cruz-Oró E, Prat S. Conserved function of FLOWERING ...
  • Palatnik JF, Allen E, Wu X, Schommer C, Schwab R, ...
  • Parcy F. Flowering: A time for integration. The International Journal ...
  • Pfeiffer N, Tränkner C, Lemnian I, Grosse I, Müller AE, ...
  • Pin PA, Zhang W, Vogt SH, Dally N, Büttner B, ...
  • Pin P, Life cycle and flowering time control in beet. ...
  • Rana TM. Illuminating the silence: Understanding the structure and function ...
  • Reinhart BJ, Weinstein EG, Rhoades MW, Bartel B, Bartel DP. ...
  • Sadeghian SY, Johansson E. Genetic study of bolting and stem ...
  • Schwarz DS, Zamore PD. Why do miRs live in the ...
  • Simpson GG. The autonomous pathway: Epigenetic and post-transcriptional gene regulation ...
  • Sung S, Amasino RM. Vernalization in Arabidopsis thaliana is mediated ...
  • Wang CM, Liu P, Sun F, Li L, Liu P, ...
  • Wang JW, Schwab R, Czech B, Mica E, Weigel D. ...
  • Wang JW, Czech B, Weigel D. MiR156-regulated SPL transcription factors ...
  • Xu P, Vernooy SY, Guo M, Hay BA. The drosophila ...
  • Yant L, Mathieu J, Dinh TT, Ott F, Lanz C, ...
  • Zhang B, Pan X, Cobb GP, Anderson TA. Plant microRNA: ...
  • Zhang BH, Pan XP, Wang QL, Cobb GP, Anderson TA. ...
  • نمایش کامل مراجع