شناسایی سریع باکتری کمپیلو باکتر ژژونی بر اساس واکنش PCR و ارزیابی حساسیت و اختصاصیت آن
- سال انتشار: 1396
- محل انتشار: مجله پزشکی بالینی ابن سینا، دوره: 24، شماره: 1
- کد COI اختصاصی: JR_SJH-24-1_008
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 476
نویسندگان
دانشجوی دوره دکتری، مرکز تحقیقات بیوتکنولوژی کاربردی، دانشگاه علوم پزشکی بقیه الله عج ، تهران، ایران
دانشیار، گروه میکروب شناسی، دانشگاه علوم پزشکی بقیه الله )عج(، تهران، ایران
دانشجوی دوره دکتری، مرکز تحقیقات بیوتکنولوژی کاربردی، دانشگاه علوم پزشکی بقیه الله عج ، تهران، ایران
استاد، گروه زیست شناسی، دانشکده علوم پایه، دانشگاه شاهد، تهران، ایران
چکیده
مقدمه: کمپیلوباکتر ژژونی از عوامل اصلی و شایع مسمومیت غذایی در انسان است. شناسایی سریع و اختصاصی این باکتری نقش مهمی در تشخیص و درمان عفونت ایفا م یکند. هدف از این مطالعه طراحی واکنش PCR اختصاصی به منظور شناسایی کمپیلو باکتر ژژونی میباشد.روش کار: در این مطالعه تجربی ژن اکسیدو ردوکتاز از باکتری کمپیلو باکتر ژژونی جهت شناسایی سریع و اختصاصی این باکتری انتخاب گردید. پرایمرهای اختصاصی جهت این کار، طراحی و خصوصیات آن توسط نرم افزارهای بیو انفورماتیکی بررسی گردید. DNA باکتری با روش فنل کلروفرم استخراج شد. اختصاصیت روش طراحی شده، با استفاده از 6 گونه باکتری بررسی شد. حساسیت واکنش PCR با روش تهیه سریال رقت از ژنوم باکتری محاسبه شد.یافته ها: نتایج نشان داد که پرایمر طراحی شده کاما اختصاصی ژن اکسیدوردوکتاز باکتری کمپیلو باکتر ژژونی بوده و پس از انجام PCR تک باند 167 جفت بازی تکثیر میشود. این پرایمر با ژنوم دیگر گونه های باکتریایی جفت نمیشود. حد تشخیص این واکنش 5 پیکوگرم از DNA ژنومی باکتری میباشد.نتیجه گیری: روش بهینه شده در این مطالعه روشی سریع، حساس و اختصاصی به منظور تشخیص کمپیلو باکتر م یباشد. به منظور تایید نتایج این مطالعه، تشخیص باکتری کمپیلو باکتر ژژونی در نمون ههای مواد غذایی توصیه میشود.کلیدواژه ها
اکسیدو ردوکتاز کمپیلو باکتر ژژونی- تشخیص واکنش زنجیره پلیمرازاطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.