Quantitative structure-activity relationship (QSAR) study of CCR2b receptor inhibitors using SW-MLR and GA-MLR approaches
- سال انتشار: 1395
- محل انتشار: فصلنامه ارتباطات شیمی ایران، دوره: 5، شماره: 1
- کد COI اختصاصی: JR_ICC-5-1_010
- زبان مقاله: انگلیسی
- تعداد مشاهده: 453
نویسندگان
Department of Chemistry, Shahrood Branch, Islamic Azad University, shahrood, Iran
چکیده
In this paper, the quantitative structure activity-relationship (QSAR) of the CCR2b receptor inhibitors was scrutinized. Firstly, the molecular descriptors were calculated using the Dragon package. Then, the stepwise multiple linear regressions (SW-MLR) and the genetic algorithm multiple linear regressions (GA-MLR) variable selection methods were subsequently employed to select and implement the prominent descriptors having the most significant contributions to the activities of the molecules. A combined data set including numerical values of inhibition activity data (IC50) of 103 CCR2b receptor derivatives was adopted for our simulations. This study revealed that both SW-MLR and GA-MLR methods consisted of six molecular descriptors. The adopted descriptors belong to topological, charge, RDF and atom-centered fragments classes. A comparison of results by the two methodologies indicated the superiority of GA-MLR over the SW-MLR method. The authenticity of the proposed model (GA-MLR) was further confirmed using the cross-validation, validation through an external test set and Y-randomization.کلیدواژه ها
QSAR, CCR2b receptor inhibitors, Genetic algorithm (GA), Stepwise (SW), Multiple linear regression (MLR), Molecular descriptorاطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.