تعیین ترادف و جایگاه فیلوژنتیکی جدایه ای از ویروس وای سیب زمینی از مزارع فلفل استان گلستان

طبق بررسی های انجام شده در طی سال های گذشته، ویروس وای سیب زمینی به عنوان یکی از ویروس های مخرب در خانواده سولاناسه استان گلستان است، علیرغم این، وجود و ترادف آن در مزارع فلفل استان تاکنون بررسی صورت نگرفته است. به منظور تعیین توالی، جایگاه فیلوژنتیکی و نیز مقایسه توالی PVY جدا شده از فلفل در استان گلستان با تعدادی از توالی های موجود در بانک ژن، از نمونه های فلفل که دارای علائمی مشابه به PVY بودند، نمونه برداری صورت گرفت. پس از تعیین آلودگی از طریق آزمون الایزا، بخشی از پروتئین پوششی ویروس با استفاده از جفت آغازگرهای عمومی پوتی ویروس ها در واکنش RT-PCR تکثیر شد. محصول PCR پس از ترادف یابی به همراه 28 توالی PVY در دنیا با نرم افزار Clustal X همردیف سازی شده و درخت فیلوژنتیکی در نرم افزار MEGA5 به روش maximum parsimony ترسیم گردید. نتایج آنالیز فیلوژنتیک نشان داد که همه توالی های PVY در 3 گروه شامل استرین های (PVY(o), PVY(c و (PVY(KTN گروه بندی شدند. جدایه دلند با جدایه های از ترکیه، فرانسه و اسپانیا که همگی دارای نژاد C می باشند و از روی میزبان فلفل جدا شده اند، با بیشترین درصد تشابه (بیش از 98 درصد) در یک گروه قرار گرفت. بنابراین می توان گفت جدایه PVY از دلند دارای نژاد C می باشد.

کلیدواژه ها:

ویروس وای سیب زمینی ، فلفل ، RT-PCR ، آنالیز فیلوژنتیک