تعیین جایگاه فیلوژنی ویروس موزائیک ایرانی قیاق در استان گلستان بر اساس ژن پروتئین پوششی
- سال انتشار: 1394
- محل انتشار: چهارمین کنگره ملی کشاورزی ارگانیک و مرسوم
- کد COI اختصاصی: NCOCA04_041
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 377
نویسندگان
دانشجوی کارشناسی ارشد بیماری شناسی گیاهی، دانشگاه تولید گیاهی، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی گرگان
دانشیار گروه گیاهپزشکی، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی گرگان
دانشجوی دکترا بیماری شناسی گیاهی دانشگاه علوم کشاورزی زابل
چکیده
یکی از مهمترین پوتی ویروس های غلات ویروس موزائیک ایرانی قیاق (Iranian Johnson grass mosaic virus, IJMV) می باشد. به منظور تعیین توالی و جایگاه فیلوژنی و نیز مقایسه IJMV جدایه استان گلستان با سایر جدایه های آن در ایران و نیز سایر پوتی ویروس های غلات در دنیا، از ذرت، سورگوم و قیاق نمونه بردای صورت گرفت. پس از آزمو الایزا، با استفاده از آزمون مولکولی RT-PCR و جفت آغازگرهای عمومی پوتی ویروس ها، Oligo1n و Oligo2n، بخشی از پروتئین پوششی ویروس به اندازه 327 جفت باز تکثیر گردید. پس از تعیین توالی، همردیف سازی چندگانه ترادف حاصل از IJMV و سایر جدایه های آن در ایران و نیز سایر پوتی ویروس های غلات در دنیا، با استفاده از نرم افزار Clustal X صورت گرفت. سپس درخت فیلوژنتیکی با استفاده از نرم افزار MEGA5 به روش Maximum parsimony بدست آمد. طبق نتایج حاصل از آنالیز فیلوژنتیکی و نیز بررسی درصد شباهت جدایه های مختلف، پوتی ویروس های غلات در 6 گروه متمایز قرار گرفتند. جدایه استان گلستان با شباهت بیش از 90 درصد در کنار جدایه های شیراز در یک گروه و نیز در کنار ویروس موزائیک زآ (با 87 درصد تشابه) ولی در زیرگروهی جداگانه قرار گرفت. این جدایه کمترین میزان تشابه را با MDMV جدایه گرگان نشان داد.کلیدواژه ها
ویروس موزائیک ایرانی قیاق، جایگاه فیلوژنی، RT-PCRمقالات مرتبط جدید
- بررسی راهبردهای ترویج انرژی های پاک در بین گلخانه داران استان البرز
- مطالعه اثر روش های مختلف خاک ورزی بر عملکرد و برخی صفات سه رقم عدس دیم
- Machine Vision Approach Coupled with a Hybrid EHD-Convective Dryer to Model Khalal Slices Drying Process with ANFIS
- انتخاب مناسب دور موتور و نوع سوخت از لحاظ ویژگیهای عملکردی موتورهای دیزلی با استفاده از روش های تصمیم سازی
- پتانسیل سنجی تولید زیستگاز از پسماندهای کشاورزی و فضولات دامی در شهرستان اهواز
اطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.