Protein functions of Cytochrome P450 enzymes for entomopathogenic fungus Beauveria bassiana (Ascomycota, Hypocreales)

  • سال انتشار: 1397
  • محل انتشار: هشتمین همایش بیوانفورماتیک ایران
  • کد COI اختصاصی: IBIS08_064
  • زبان مقاله: انگلیسی
  • تعداد مشاهده: 398
دانلود فایل این مقاله

نویسندگان

مریم راشکی

۱گروه تنوع زیستی، پژوهشکده علوم محیطی، پژوهشگاه علوم، تکنولوژی پیشرفته و علوم محیطی، دانشگاه تحصیلات تکمیلی صنعتی و فناوری پیشرفته، کرمان

مجتبی مرتضوی

۲گروه بیوتکنولوژی، پژوهشکده علوم محیطی، پژوهشگاه علوم، تکنولوژی پیشرفته و علوم محیطی، دانشگاه تحصیلات تکمیلی صنعتی و فناوری پیشرفته، کرمان

چکیده

To investigate transmembrane helixes in the protein structures of the seven cytochrome P450 enzymes for Beauveria bassiana, the TMHM (1) program; to detect signal peptides and other protease shear sites, the SignalP program (2); and to study some physical and chemical parameters of the examined proteins, the ProtParam program were used. The results showed that the number of transmembrane helixes in different sequences varied from 0 to 2. The CYP5337A1 and CYP52G11 did not have the helix and the CYP51F1 (yeast) and CYP53A2 had two helixes. In all cases (except CYP58), estimated amino acids of hellixes were greater than 18 and increased the probability of the transmembrane protein being present. In none of the analyzed sequences, peptide signal was detected. The shear region in different sequences was located between positions 14-31 to 17-39. The molecular weight of proteins was calculated between 57,000 and 64,000. Also, the results showed that only the CYP539B5 and CYP52G11 proteins were stable. The CYP584Q1 and CYP617N1 had the highest and lowest amount of hydrophilic amino acids, respectively. The highest and lowest aliphatic indexes were related to the CYP617N1 and CYP52X1, respectively, that was directly related to the degree of heat tolerance.

کلیدواژه ها

Beauveria bassiana, Cytochrome P450, helix, peptide signal, software

اطلاعات بیشتر در مورد COI

COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.

کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.