Bioinformatic and molecular analysis of seed-specific promoter SBP in Tobacco

  • سال انتشار: 1397
  • محل انتشار: هشتمین همایش بیوانفورماتیک ایران
  • کد COI اختصاصی: IBIS08_014
  • زبان مقاله: انگلیسی
  • تعداد مشاهده: 578
دانلود فایل این مقاله

نویسندگان

نسیبه چنارانی

۱دانشگاه زابل، دانشکده کشاورزی،گروه اصلاح نباتات و بیوتکنولوژی

عباسعلی امام جمعه

۲عضو هیئت علمی/دانشگاه زابل، دانشکده کشاورزی، گروه اصلاح نباتات و بیوتکنولوژی

حسن رهنما

۳عضو هیات علمی/پژوهشگاه بیوتکنولوژی کشاورزی ایران، کرج

کتایون زمانی

۴عضو هیات علمی، پژوهشگاه بیوتکنولوژی کشاورزی ایران، کرج

چکیده

Tissue-specific promoters limit gene expression to certain cells, tissues, organs, or developmental stages that have many applications in genetically modified crops[1]. Considering the importance of increasing seed oil content in safflower, in this study, a synthetic seed specific promoter, sucrose binding protein (SBP) from Vicia faba was tested for its activity in transgenic tobacco plants. The probably regulatory cis-elements of the promoter sequence were identified using the online software tools PLANTCARE[2] and PLACE[3]. Database searching revealed that this region contains eleven cis-acting regulatory element involved in seed-specific regulation which are CAATBOX1, ABREOSRAB21, DPBFCOREDCDC3, SEF1MOTIF, SEF4MOTIFGM7S, MYB1AT, -300ELEMENT, CAREOSREP1, GADOWNAT, GADOWNAT and CEREGLUBOX2PSLEGA. The SBP promoter sequence was synthesized by GENEray Company. Correctness of the promoter region was confirmed by restriction enzyme digestion and PCR. The sequence was inserted to the GUS gene upstream in pBI121 vector using general cloning methods[4] to produce SBP promoter or GUS construct. The construct was transformed into Agrobacterium tumefaciens strain EHA105[5] and then Tobacco plants were transformed by leaf disk procedures. The functionality of the SBP promoter was confirmed in stably transformed tobacco plants and it can be employed for seed specific expression in crop breeding projects

کلیدواژه ها

sucrose binding protein, tissue,specific promoter, tobacco, PLACE, PLANTCARE

اطلاعات بیشتر در مورد COI

COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.

کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.